More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1032 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 163 aa  337  5e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  68.06 
 
 		 149 aa  215  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  68.06 
 
 		 149 aa  215  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  65.77 
 
 		 147 aa  206  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  185  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  185  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 146 aa  185  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  61.76 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 147 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  60.29 
 
 		 146 aa  180  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 145 aa  177  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 145 aa  174  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  174  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 149 aa  173  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.88 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  55.88 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  171  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  171  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 146 aa  170  5.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  55.4 
 
 		 144 aa  170  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 170 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  52.9 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  52.9 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  170  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 150 aa  170  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  170  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 150 aa  170  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 148 aa  170  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2727  ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000734549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  53.96 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  55.15 
 
 		 149 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  60.31 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  60.31 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  55.1 
 
 		 149 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  55.15 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  54.41 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>