More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1026 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  100 
 
 
364 aa  744  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  62.26 
 
 
364 aa  475  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  44.05 
 
 
374 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  41.19 
 
 
390 aa  285  6e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  40.75 
 
 
391 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  40.75 
 
 
391 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  40.21 
 
 
391 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  40.21 
 
 
391 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  40.48 
 
 
391 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  40.48 
 
 
391 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  40.21 
 
 
391 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  41.02 
 
 
391 aa  275  1e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  40.75 
 
 
391 aa  274  2e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  44.24 
 
 
373 aa  272  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  39.95 
 
 
392 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  43.43 
 
 
373 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  40.21 
 
 
373 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  40.53 
 
 
377 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  42.59 
 
 
379 aa  265  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  40.05 
 
 
371 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  42.9 
 
 
373 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  39.35 
 
 
398 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  40.21 
 
 
408 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  40.32 
 
 
370 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  41.64 
 
 
388 aa  255  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  39.25 
 
 
389 aa  255  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  40.8 
 
 
384 aa  255  1e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  40.31 
 
 
380 aa  254  2e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  40.63 
 
 
380 aa  254  2e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  37.97 
 
 
379 aa  254  2e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  39.3 
 
 
370 aa  252  8e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  38.46 
 
 
433 aa  252  9e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  42.23 
 
 
365 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  39.89 
 
 
387 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  39.47 
 
 
389 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  40.81 
 
 
369 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  37.37 
 
 
373 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  39.07 
 
 
384 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  40.59 
 
 
391 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  37.77 
 
 
382 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  39.19 
 
 
390 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  39.31 
 
 
386 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  39.31 
 
 
386 aa  242  8e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  39.11 
 
 
379 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  40.7 
 
 
389 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  40.7 
 
 
389 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  40.16 
 
 
389 aa  236  5e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.85 
 
 
379 aa  236  5e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  38.98 
 
 
369 aa  235  9e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  38.07 
 
 
376 aa  235  1e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  39.62 
 
 
389 aa  234  1e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  40.16 
 
 
389 aa  234  1e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  39.89 
 
 
389 aa  234  1e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  39.89 
 
 
389 aa  234  1e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  39.89 
 
 
389 aa  234  2e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  39.89 
 
 
389 aa  234  2e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  39.62 
 
 
389 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  38.11 
 
 
389 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  36.12 
 
 
382 aa  229  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.96 
 
 
378 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  36.51 
 
 
380 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  37.7 
 
 
367 aa  223  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  35.96 
 
 
390 aa  219  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  36.34 
 
 
390 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  35.31 
 
 
382 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  35.31 
 
 
382 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  36.24 
 
 
388 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  38.8 
 
 
851 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  36.77 
 
 
375 aa  213  4e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  33.69 
 
 
395 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  36.93 
 
 
373 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  34.32 
 
 
403 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  37.4 
 
 
375 aa  210  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.32 
 
 
403 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1380  alanine racemase  36.6 
 
 
355 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000410979  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  33.24 
 
 
441 aa  210  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  36.63 
 
 
376 aa  209  6e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  34.16 
 
 
367 aa  209  7e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  34.55 
 
 
411 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  32.8 
 
 
380 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  36.01 
 
 
356 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  35.07 
 
 
393 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  36.89 
 
 
366 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  37.91 
 
 
388 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  33.16 
 
 
384 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  31.98 
 
 
384 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  36.07 
 
 
842 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  33.69 
 
 
376 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  34.95 
 
 
374 aa  202  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  37.53 
 
 
368 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  31.88 
 
 
383 aa  201  1e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  31.88 
 
 
383 aa  201  1e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  31.88 
 
 
383 aa  201  1e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  34.67 
 
 
381 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  33.25 
 
 
397 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  32.43 
 
 
403 aa  200  4e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  34.85 
 
 
380 aa  200  4e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  37.07 
 
 
379 aa  199  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  34.5 
 
 
371 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  36.41 
 
 
396 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>