More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0976 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 74 aa  150  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1115  translation initiation factor IF-1  84.93 
 
 		 90 aa  135  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000159264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1371  translation initiation factor IF-1  82.86 
 
 		 74 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1315  translation initiation factor IF-1  82.86 
 
 		 74 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000270736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  70.42 
 
 		 72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 		 72 aa  117  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 		 72 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 		 72 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 		 72 aa  116  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 73 aa  116  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3117  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 		 73 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 		 73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  72.86 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  74.65 
 
 		 73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  71.83 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 75 aa  114  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 		 73 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 		 73 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 		 73 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  68.49 
 
 		 73 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 		 73 aa  113  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 		 73 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 		 73 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 		 73 aa  113  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  70.42 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  67.12 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 72 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  69.01 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3388  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 		 73 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4974  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 		 73 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1887  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000185401  hitchhiker  0.0000121311 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  70.42 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  67.61 
 
 		 73 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1567  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216088  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2698  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000441165  normal  0.11278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  68.57 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000358057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000207147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  68.57 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1167  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 		 73 aa  110  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3900  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2531  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  110  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1137  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1108  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20640  translation initiation factor 1  67.12 
 
 		 73 aa  110  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.355851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1125  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.609417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1431  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4484  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>