More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0949 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  80.65 
 
 		 155 aa  266  5.9999999999999995e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  80.65 
 
 		 155 aa  266  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  74.19 
 
 		 155 aa  250  4.0000000000000004e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  69.68 
 
 		 155 aa  235  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  214  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  69.33 
 
 		 159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 155 aa  209  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  66.89 
 
 		 157 aa  203  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  60.53 
 
 		 157 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 		 155 aa  194  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  62.59 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 155 aa  192  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  59.18 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1832  ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000136289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  59.21 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 157 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  58.55 
 
 		 157 aa  190  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  189  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  59.18 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  57.82 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  54.11 
 
 		 157 aa  186  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  57.82 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  56.46 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  55.1 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  56.46 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  55.78 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3276  30S ribosomal protein S7  53.29 
 
 		 157 aa  184  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000398939  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  52.9 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 		 155 aa  183  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0388  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 		 157 aa  183  1.0000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  51.3 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  51.61 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4008  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  54.42 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>