More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0926 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  79.83 
 
 		 259 aa  394  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  81.94 
 
 		 260 aa  387  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  81.5 
 
 		 262 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  69.57 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  70.04 
 
 		 233 aa  338  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  66.67 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  67.22 
 
 		 262 aa  335  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  62.11 
 
 		 262 aa  335  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  68.28 
 
 		 235 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  69.16 
 
 		 232 aa  333  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  66.96 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  68.72 
 
 		 235 aa  333  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  60.55 
 
 		 255 aa  331  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  60.55 
 
 		 255 aa  331  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  65.4 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  66.96 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  68.61 
 
 		 248 aa  329  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  60.32 
 
 		 252 aa  328  7e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  66.81 
 
 		 232 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  63.01 
 
 		 252 aa  323  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  71.49 
 
 		 243 aa  323  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  65.64 
 
 		 233 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  64.49 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  62.08 
 
 		 281 aa  319  3e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  65.64 
 
 		 233 aa  319  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  65.64 
 
 		 233 aa  319  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  66.09 
 
 		 235 aa  319  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  66.08 
 
 		 233 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  61.57 
 
 		 262 aa  316  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  63.91 
 
 		 280 aa  316  3e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  63.88 
 
 		 236 aa  315  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  62.28 
 
 		 233 aa  311  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  62.28 
 
 		 233 aa  311  9e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  57.42 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  62.83 
 
 		 255 aa  308  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  62.83 
 
 		 255 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  61.67 
 
 		 256 aa  307  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  63.68 
 
 		 289 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  60.99 
 
 		 343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  57.43 
 
 		 315 aa  304  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  60.99 
 
 		 314 aa  304  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  61.06 
 
 		 301 aa  303  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  59.83 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  56.57 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  60.24 
 
 		 255 aa  301  5.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  61.23 
 
 		 251 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  59.21 
 
 		 246 aa  301  9e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  61.36 
 
 		 301 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  60.62 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  59.47 
 
 		 255 aa  298  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  56.08 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 257 aa  295  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  52.67 
 
 		 262 aa  295  7e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 257 aa  294  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  58.23 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  56.15 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  55.69 
 
 		 260 aa  293  3e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  59.03 
 
 		 267 aa  291  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  60.35 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  57.71 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  52.53 
 
 		 264 aa  289  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  56.27 
 
 		 289 aa  289  4e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  56.33 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  53.02 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  59.82 
 
 		 316 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  55.73 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1276  30S ribosomal protein S2  59.19 
 
 		 271 aa  286  2.9999999999999996e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000462027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  54.37 
 
 		 300 aa  285  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  55.74 
 
 		 269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  58.95 
 
 		 353 aa  285  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  52.59 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 296 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  53.97 
 
 		 289 aa  284  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  52.59 
 
 		 245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  54.33 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  53.97 
 
 		 260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  54.62 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  55.25 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  55.9 
 
 		 250 aa  281  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 268 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 268 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 279 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  55.95 
 
 		 272 aa  281  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 287 aa  281  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10101  30S ribosomal protein S2  55.04 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0824098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  58.08 
 
 		 317 aa  280  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16641  30S ribosomal protein S2  55.84 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.503664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1247  30S ribosomal protein S2  55.84 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  52.32 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>