More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0911 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0911  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
189 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0801  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.3 
 
 
188 aa  136  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0783  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.6 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0760  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.6 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.52 
 
 
199 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.52 
 
 
199 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
203 aa  111  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.37 
 
 
202 aa  111  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.79 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.88 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0577  Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit  36.73 
 
 
194 aa  109  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  31.03 
 
 
206 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 
200 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
204 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
204 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
204 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.65 
 
 
202 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  32.5 
 
 
203 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  32.5 
 
 
203 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.47 
 
 
200 aa  104  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  104  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  104  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1209  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
188 aa  104  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  104  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  104  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  104  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 
194 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.68 
 
 
205 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.84 
 
 
196 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 
203 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.67 
 
 
205 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.53 
 
 
204 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
199 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.68 
 
 
207 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
205 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
205 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
205 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.57 
 
 
209 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.61 
 
 
202 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.51 
 
 
202 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
205 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.09 
 
 
193 aa  101  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.09 
 
 
193 aa  101  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
203 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
203 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
203 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 
205 aa  101  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
203 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 
205 aa  101  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
204 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.72 
 
 
201 aa  100  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
211 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
203 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  37.97 
 
 
199 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.66 
 
 
200 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 
199 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.46 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.93 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.48 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  33.51 
 
 
194 aa  99  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
193 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.89 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2103  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
205 aa  97.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
205 aa  97.8  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
203 aa  97.8  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.76 
 
 
206 aa  97.8  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
204 aa  97.8  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.78 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.78 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.68 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.68 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
198 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.71 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2477  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.91 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.389677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.7 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.31 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.36 
 
 
205 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.36 
 
 
205 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.36 
 
 
205 aa  94.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1051  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.58 
 
 
186 aa  94.4  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.23 
 
 
208 aa  94.4  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3138  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
205 aa  94.4  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
200 aa  94.4  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.09 
 
 
196 aa  94  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>