More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0910 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  58.04 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  56.57 
 
 
256 aa  298  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  56.75 
 
 
274 aa  294  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  45.49 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  45.91 
 
 
256 aa  232  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  42.91 
 
 
464 aa  225  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  45.1 
 
 
257 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  41.2 
 
 
258 aa  222  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  45.1 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  45.1 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.1 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.1 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  45.1 
 
 
255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.1 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  45.1 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  45.28 
 
 
255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  44.31 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  44.71 
 
 
255 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  45.1 
 
 
606 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  41.18 
 
 
256 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  41.57 
 
 
461 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  46.15 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  44.71 
 
 
255 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  43.92 
 
 
462 aa  215  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  44.8 
 
 
255 aa  214  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  41.04 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  43.92 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  43.31 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  43.04 
 
 
261 aa  212  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  40.16 
 
 
255 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  44.31 
 
 
257 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  44.27 
 
 
262 aa  208  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  40.87 
 
 
256 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  41.41 
 
 
264 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  43.53 
 
 
255 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  41.96 
 
 
462 aa  204  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.94 
 
 
457 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  42.52 
 
 
256 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  43.75 
 
 
257 aa  203  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  40.08 
 
 
256 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  42.73 
 
 
261 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 
256 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 
271 aa  198  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  43.72 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  42.68 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  41.73 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  40.16 
 
 
257 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  39.76 
 
 
458 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  41.57 
 
 
255 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  39.37 
 
 
458 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  40.5 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  39.53 
 
 
257 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  39.53 
 
 
257 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  42.23 
 
 
251 aa  188  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  39.84 
 
 
264 aa  188  8e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 
256 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  38.58 
 
 
268 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  41.77 
 
 
253 aa  186  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  38.67 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  38.89 
 
 
259 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  38.98 
 
 
264 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  38.58 
 
 
260 aa  178  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  33.6 
 
 
271 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  36.14 
 
 
264 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  37.65 
 
 
256 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  39.22 
 
 
254 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  40 
 
 
269 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  36.82 
 
 
263 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  34.76 
 
 
264 aa  174  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  36.36 
 
 
268 aa  175  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  34.39 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  37.25 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  33.86 
 
 
273 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  33.6 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 
256 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  35.87 
 
 
263 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  34.65 
 
 
270 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  37.5 
 
 
454 aa  169  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  35.83 
 
 
256 aa  168  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 
263 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0103  TatD family hydrolase  35.88 
 
 
269 aa  166  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0970628  normal  0.125784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  33.6 
 
 
273 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  33.73 
 
 
260 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  32.81 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  36.33 
 
 
259 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  33.47 
 
 
258 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  33.85 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  35.37 
 
 
273 aa  164  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  36.08 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  34.78 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  34.62 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  35.18 
 
 
263 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 
276 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  35.02 
 
 
273 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  34.92 
 
 
262 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  34.77 
 
 
260 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  32.56 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>