More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0892 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
318 aa  642  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  68.45 
 
 
317 aa  464  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  61.2 
 
 
320 aa  405  1e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  56.51 
 
 
323 aa  348  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.06 
 
 
327 aa  342  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  60.53 
 
 
274 aa  340  3e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  54.29 
 
 
323 aa  339  3e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  51.46 
 
 
329 aa  335  6e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  52.38 
 
 
319 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  54.6 
 
 
316 aa  324  1e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  51.61 
 
 
326 aa  320  2e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.48 
 
 
338 aa  309  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.16966e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  45.51 
 
 
319 aa  305  5e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  46.95 
 
 
320 aa  305  6e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  8.53458e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  46.2 
 
 
322 aa  303  2e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  45.62 
 
 
322 aa  302  4e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  47.91 
 
 
315 aa  300  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  45.89 
 
 
322 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  45.08 
 
 
319 aa  296  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  46.67 
 
 
327 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  46.67 
 
 
327 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2328  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.21 
 
 
317 aa  295  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2371  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.21 
 
 
317 aa  295  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.421154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  47.59 
 
 
324 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  46.54 
 
 
339 aa  292  6e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0193  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.69 
 
 
329 aa  284  1e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.15 
 
 
331 aa  284  1e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  44.62 
 
 
334 aa  283  2e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.66306e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  44.51 
 
 
318 aa  281  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  45.6 
 
 
328 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1888  glycerate dehydrogenase  46.18 
 
 
317 aa  275  6e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  41.32 
 
 
341 aa  274  2e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  46.27 
 
 
333 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  46.58 
 
 
333 aa  270  3e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1137  glycerate dehydrogenase  47.57 
 
 
323 aa  270  3e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.657649  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.77 
 
 
335 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  44.03 
 
 
332 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  44.41 
 
 
334 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  41.32 
 
 
340 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01500  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  43.95 
 
 
329 aa  266  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.67 
 
 
332 aa  265  6e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.14509e-07 
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  42.81 
 
 
331 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1774  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.61 
 
 
328 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2390  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.01 
 
 
324 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.129625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1337  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.77 
 
 
323 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  39.62 
 
 
328 aa  262  5e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  44.73 
 
 
322 aa  262  6e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.81 
 
 
329 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501657  normal  0.548764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  42.45 
 
 
330 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.07425e-10 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0811  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.13 
 
 
329 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868894  normal  0.495014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.84 
 
 
326 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.14 
 
 
338 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1299  glycerate dehydrogenase  46.45 
 
 
323 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1055  putative 2-ketogluconate reductase  42.17 
 
 
329 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453288  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  40.39 
 
 
357 aa  259  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3876  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  45.81 
 
 
323 aa  258  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.96 
 
 
319 aa  258  9e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  44.55 
 
 
357 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.96 
 
 
319 aa  258  9e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  42.59 
 
 
334 aa  258  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  42.03 
 
 
330 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1468  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  45.81 
 
 
323 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2855  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.52 
 
 
345 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.25 
 
 
323 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1434  glycerate dehydrogenase  46.13 
 
 
323 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1325  glycerate dehydrogenase  46.13 
 
 
323 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  40.88 
 
 
328 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  40.25 
 
 
328 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1298  glycerate dehydrogenase  46.13 
 
 
323 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.952061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  43.35 
 
 
328 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1506  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.13 
 
 
339 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0180022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1574  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.43 
 
 
323 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.81 
 
 
334 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  41.98 
 
 
334 aa  256  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1535  glycerate dehydrogenase  46.13 
 
 
323 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2281  2-hydroxyacid dehydrogenase  39.81 
 
 
331 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.81 
 
 
333 aa  254  1e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  42.95 
 
 
331 aa  254  1e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  44.87 
 
 
321 aa  254  1e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2171  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  43.27 
 
 
319 aa  254  1e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.16 
 
 
326 aa  253  2e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.16 
 
 
326 aa  253  2e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  43.26 
 
 
331 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  42.5 
 
 
334 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  42.36 
 
 
360 aa  253  4e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  39.94 
 
 
339 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  40.13 
 
 
348 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1062  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.13 
 
 
329 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.58591e-05  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  40.58 
 
 
352 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  40.58 
 
 
346 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  40.58 
 
 
346 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0513  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.58 
 
 
329 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1103  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.74 
 
 
329 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0624  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.74 
 
 
329 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.46 
 
 
332 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2870  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  40.58 
 
 
352 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2926  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.58 
 
 
329 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4216  2-hydroxyacid dehydrogenase  42.49 
 
 
329 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243967  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  40.07 
 
 
329 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  40.06 
 
 
323 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>