218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0875 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  895    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  61.99 
 
 
472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  58.71 
 
 
474 aa  545  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  58.92 
 
 
474 aa  543  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  52.39 
 
 
480 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  52.39 
 
 
480 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  52.16 
 
 
480 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  50.11 
 
 
480 aa  437  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  50.23 
 
 
500 aa  432  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  50 
 
 
486 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  51.14 
 
 
484 aa  427  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  48.29 
 
 
484 aa  426  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  45.61 
 
 
477 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  49.89 
 
 
486 aa  420  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  47.07 
 
 
482 aa  420  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  47.15 
 
 
498 aa  419  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  45 
 
 
460 aa  420  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  48.06 
 
 
484 aa  421  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  49.77 
 
 
473 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  47.2 
 
 
486 aa  413  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  46.79 
 
 
480 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  46.33 
 
 
482 aa  413  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  47.33 
 
 
477 aa  414  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  44.87 
 
 
475 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  43.78 
 
 
486 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  46.08 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  45.95 
 
 
478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  43.4 
 
 
482 aa  404  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  44.49 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  44.49 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  43.75 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  46.71 
 
 
486 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  46.17 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  46.49 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  47.48 
 
 
477 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  45.16 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  43.07 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  47.78 
 
 
477 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  44.16 
 
 
475 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  47.73 
 
 
484 aa  397  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  45 
 
 
485 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  43.63 
 
 
473 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  47.38 
 
 
477 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  45 
 
 
485 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  44.09 
 
 
476 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  46.34 
 
 
484 aa  395  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  45.68 
 
 
493 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  43.35 
 
 
476 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  45.45 
 
 
484 aa  393  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  43.1 
 
 
476 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  44.32 
 
 
485 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  42.46 
 
 
488 aa  388  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  41.9 
 
 
476 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  42.15 
 
 
476 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  43.63 
 
 
473 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  42 
 
 
488 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  48.06 
 
 
486 aa  382  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  43.84 
 
 
476 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  44.47 
 
 
963 aa  375  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  40.21 
 
 
479 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  41.24 
 
 
502 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  42.89 
 
 
485 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  43.3 
 
 
465 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  46.01 
 
 
486 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  47.56 
 
 
988 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  43.36 
 
 
481 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  42.33 
 
 
472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  44.61 
 
 
475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  40 
 
 
487 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  40 
 
 
487 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  40.78 
 
 
478 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  39.79 
 
 
488 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  41.13 
 
 
472 aa  351  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  43.79 
 
 
514 aa  338  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  44.71 
 
 
462 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  41.38 
 
 
447 aa  302  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  37.79 
 
 
451 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  32.89 
 
 
396 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  31.23 
 
 
470 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  31.77 
 
 
398 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  30.91 
 
 
402 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3081  protein of unknown function UPF0027  30.42 
 
 
409 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  28.31 
 
 
398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  27.81 
 
 
511 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  30.84 
 
 
398 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  30.84 
 
 
398 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  29.04 
 
 
410 aa  170  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  31.37 
 
 
404 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.47 
 
 
409 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  30.73 
 
 
514 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  28.89 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  30.97 
 
 
404 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  29.7 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  29.49 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  28.51 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  27.06 
 
 
399 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  30.07 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  30.55 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  29.37 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  29.93 
 
 
410 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>