More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0868 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  100 
 
 
266 aa  531  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  65.02 
 
 
275 aa  353  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  62.55 
 
 
400 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  58.11 
 
 
278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  56.98 
 
 
278 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  58.62 
 
 
376 aa  295  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  57.98 
 
 
397 aa  290  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  50 
 
 
397 aa  270  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  51.47 
 
 
356 aa  256  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
283 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 
286 aa  249  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 
394 aa  248  9e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
283 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
283 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  49.23 
 
 
285 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  49.03 
 
 
286 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 
277 aa  246  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
277 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
277 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
286 aa  244  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  46.69 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  45.72 
 
 
279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
277 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  46.59 
 
 
277 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
282 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
282 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  46.47 
 
 
282 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
282 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
282 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  48.46 
 
 
283 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
283 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
282 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
282 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 
396 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 
282 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
282 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  48.66 
 
 
394 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 
277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 
279 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
277 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
283 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
277 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  46.9 
 
 
259 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 
276 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 
277 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 
277 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
277 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 
277 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  44.44 
 
 
275 aa  236  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  49.06 
 
 
281 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 
277 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 
283 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
280 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
284 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 
270 aa  235  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  44.61 
 
 
282 aa  234  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  46.1 
 
 
402 aa  234  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  45.98 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 
280 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
277 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  48.08 
 
 
269 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  48.46 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  48.08 
 
 
269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
282 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
277 aa  232  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 
393 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
294 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  41.57 
 
 
276 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  43.18 
 
 
400 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 
277 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 
277 aa  228  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 
279 aa  228  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 
275 aa  228  8e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 
280 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0420  dihydropteroate synthase  42.18 
 
 
291 aa  227  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0615939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  47.1 
 
 
276 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
283 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
272 aa  226  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 
291 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  40.45 
 
 
277 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  45.35 
 
 
283 aa  225  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  41.95 
 
 
283 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1374  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
380 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000647265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 
280 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 
277 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 
290 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 
303 aa  222  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>