More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0838 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
514 aa  1026    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  53.93 
 
 
579 aa  558  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.12 
 
 
546 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.93 
 
 
546 aa  538  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.09 
 
 
530 aa  536  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000341148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.52 
 
 
530 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.49 
 
 
571 aa  532  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.67 
 
 
541 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.19 
 
 
530 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.96 
 
 
529 aa  525  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.31 
 
 
538 aa  525  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0706  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.89 
 
 
543 aa  519  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2109  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.59 
 
 
570 aa  457  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.76 
 
 
532 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.58 
 
 
539 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.56 
 
 
541 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.66 
 
 
530 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.73 
 
 
533 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.29 
 
 
584 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  41.3 
 
 
572 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.64 
 
 
531 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.66 
 
 
550 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.27 
 
 
528 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.27 
 
 
528 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.2 
 
 
532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  40.48 
 
 
530 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.92 
 
 
527 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.03 
 
 
527 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.25 
 
 
550 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  39.31 
 
 
656 aa  393  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.22 
 
 
482 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.51 
 
 
467 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.04 
 
 
538 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.49 
 
 
527 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.51 
 
 
466 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.93 
 
 
511 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.7 
 
 
525 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.7 
 
 
528 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  46.93 
 
 
529 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  46.7 
 
 
528 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  46.7 
 
 
528 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  46.7 
 
 
525 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  46.7 
 
 
533 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  46.7 
 
 
528 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.7 
 
 
528 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.45 
 
 
595 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.98 
 
 
498 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.86 
 
 
565 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  46.39 
 
 
485 aa  381  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.33 
 
 
474 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  40.54 
 
 
589 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.36 
 
 
532 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  37.55 
 
 
561 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.34 
 
 
561 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.79 
 
 
562 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.53 
 
 
570 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.91 
 
 
590 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.68 
 
 
590 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.06 
 
 
405 aa  364  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.21 
 
 
643 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.32 
 
 
562 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.64 
 
 
574 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.36 
 
 
509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  48.21 
 
 
528 aa  357  3.9999999999999996e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.3 
 
 
623 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.93 
 
 
622 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.93 
 
 
622 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.5 
 
 
606 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.27 
 
 
640 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  38.61 
 
 
531 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.31 
 
 
579 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.27 
 
 
640 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.27 
 
 
640 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.67 
 
 
619 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.27 
 
 
640 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.84 
 
 
506 aa  353  5e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.84 
 
 
506 aa  353  5e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  45.39 
 
 
580 aa  351  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.01 
 
 
640 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  46.83 
 
 
527 aa  350  3e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.34 
 
 
589 aa  348  9e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  46.23 
 
 
521 aa  348  1e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.85 
 
 
625 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.56 
 
 
528 aa  347  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.68 
 
 
599 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.04 
 
 
605 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2611  DEAD/DEAH box helicase-like  44.85 
 
 
500 aa  346  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000048378  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.55 
 
 
584 aa  346  7e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.42 
 
 
646 aa  345  8e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.57 
 
 
581 aa  345  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2402  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.49 
 
 
634 aa  345  8.999999999999999e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.208521  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0086  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.87 
 
 
604 aa  345  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.389821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.4 
 
 
583 aa  345  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  44.1 
 
 
579 aa  345  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  45.01 
 
 
595 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  37.48 
 
 
574 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.95 
 
 
597 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.38 
 
 
637 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.08 
 
 
591 aa  342  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3324  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.71 
 
 
446 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>