16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0835 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0835  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  304  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1183  hypothetical protein  52.6 
 
 
152 aa  155  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1145  hypothetical protein  54.55 
 
 
152 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0303  hypothetical protein  49.03 
 
 
153 aa  144  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.993336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1942  hypothetical protein  44.26 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00412294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0035  protein of unknown function DUF327  32.11 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15530  hypothetical protein  26.67 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0450  hypothetical protein  29.91 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3914  hypothetical protein  27.35 
 
 
146 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3232  protein of unknown function DUF327  30.16 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1375  hypothetical protein  25.55 
 
 
150 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00361251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1683  hypothetical protein  26.87 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1618  hypothetical protein  24.75 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.26552  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3035  protein of unknown function DUF327  30.77 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0160  protein of unknown function DUF327  27.34 
 
 
155 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0708  hypothetical protein  24.75 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>