74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0788 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  411  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  49.52 
 
 
213 aa  203  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  49.52 
 
 
213 aa  203  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  175  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  46.12 
 
 
217 aa  173  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  36.79 
 
 
215 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3884  hypothetical protein  31.01 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  25.59 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  27.49 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  25.59 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  29.09 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  29.09 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  26.54 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  25.12 
 
 
226 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0369  hypothetical protein  31.01 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000496164  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  30.29 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  25.85 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  25.11 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  23.7 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  23.7 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  23.7 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  23.7 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  23.7 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  23.7 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  23.7 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  24.64 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  24.53 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  23.7 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  24.53 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  22.75 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  24.17 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  28.14 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  23.18 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  23.18 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  23.64 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  24.48 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  23.18 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  23.19 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  23.56 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  23.39 
 
 
225 aa  61.6  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  25.22 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  22.52 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  22.42 
 
 
224 aa  58.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  27.27 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  22.39 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  26.79 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  22.12 
 
 
238 aa  55.5  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  28.64 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  26.29 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  24.3 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  26.79 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  21.2 
 
 
226 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0152  hypothetical protein  26.44 
 
 
207 aa  52  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  24.3 
 
 
215 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  21.15 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  22.9 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  22.9 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  24.74 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  21.5 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  24.74 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  22.9 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  22.43 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  23.47 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  21.69 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  27.33 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  24.29 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  24.85 
 
 
205 aa  45.4  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  23.71 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  21.96 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  26.09 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  22.49 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  27.97 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  23.04 
 
 
212 aa  42  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  25.58 
 
 
209 aa  41.6  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>