More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0751 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
277 aa  548  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.13 
 
 
279 aa  387  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.03 
 
 
279 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.43 
 
 
276 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
297 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
270 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
291 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0439942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
273 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
273 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
273 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
273 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  39.1 
 
 
273 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  39.1 
 
 
273 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  39.1 
 
 
273 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
273 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  39.1 
 
 
273 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  39.1 
 
 
273 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
279 aa  201  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96596  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0325  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  39.43 
 
 
281 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0316  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  39.43 
 
 
281 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
270 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3019  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.63 
 
 
281 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0376  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  39.07 
 
 
281 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
297 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0300  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  37.99 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2710  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.71 
 
 
281 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0397  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.71 
 
 
281 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2742  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.27 
 
 
281 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3724  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.27 
 
 
281 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3211  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.27 
 
 
281 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.198924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1762  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.27 
 
 
281 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3753  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.27 
 
 
281 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2792  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.27 
 
 
281 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3695  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  37.91 
 
 
281 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2016  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein  40.59 
 
 
284 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0189923 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3494  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  41.04 
 
 
281 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2711  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.82 
 
 
281 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027951  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.81 
 
 
282 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342174  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
283 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0857223  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1266  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  40.32 
 
 
282 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75502  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
273 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.55 
 
 
319 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  38.2 
 
 
273 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
283 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0236  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  36.56 
 
 
281 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.325941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
291 aa  179  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
282 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
282 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
295 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
282 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110391  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
282 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.70012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0446  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.65 
 
 
281 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152206  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
282 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  35.84 
 
 
280 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  34.31 
 
 
278 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0113  putative sugar ABC transporter (permease protein)  39.18 
 
 
282 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
282 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17735  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3511  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.65 
 
 
281 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450535  normal  0.0797424 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1285  twin-arginine translocation pathway signal  37.28 
 
 
283 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06398  ABC-type sugar transport system permease  44.76 
 
 
282 aa  175  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3653  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  36.2 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.703589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3960  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  36.2 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.53735  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0258  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  36.2 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.930102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
283 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.697078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
280 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
278 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  36.09 
 
 
272 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2095  sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter, binding protein inner membrane component  43.33 
 
 
282 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.565936 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
272 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
299 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
280 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
307 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
301 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0210527 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
722 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1695  hypothetical protein  38.49 
 
 
275 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1694  hypothetical protein  38.11 
 
 
275 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
282 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.174842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.81 
 
 
302 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
282 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.38 
 
 
296 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3730  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.77 
 
 
281 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12849  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpE  32.44 
 
 
275 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>