More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0744 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  858    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  63.72 
 
 		 421 aa  574  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 		 420 aa  513  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 419 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 419 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 423 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 413 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  43.65 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 415 aa  363  4e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 415 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 419 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 421 aa  358  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 417 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 457 aa  352  5e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 410 aa  346  4e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 430 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 414 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 441 aa  344  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 411 aa  342  9e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  42.62 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 417 aa  339  4e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 414 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 426 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 430 aa  335  7e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 446 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 446 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 446 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 446 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 446 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 446 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 464 aa  333  3e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 446 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 446 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 422 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 446 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 423 aa  332  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 447 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 446 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 420 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 440 aa  329  6e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 429 aa  329  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>