More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0736 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 815 aa  1629    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  53.22 
 
 		 647 aa  556  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  48.34 
 
 		 555 aa  503  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  48.34 
 
 		 555 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  35.62 
 
 		 499 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  37.78 
 
 		 455 aa  260  6e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  35.2 
 
 		 515 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  38.35 
 
 		 493 aa  251  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  37.16 
 
 		 454 aa  249  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  30.83 
 
 		 541 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  35.68 
 
 		 654 aa  243  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  31.88 
 
 		 595 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  30.63 
 
 		 541 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  30.63 
 
 		 545 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  31.99 
 
 		 593 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  33.59 
 
 		 575 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  32.12 
 
 		 583 aa  228  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  32.57 
 
 		 522 aa  228  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  32.48 
 
 		 524 aa  221  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  30.75 
 
 		 509 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  28.81 
 
 		 588 aa  210  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  31.24 
 
 		 441 aa  204  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  30.19 
 
 		 441 aa  204  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  28.24 
 
 		 1123 aa  203  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  28.77 
 
 		 551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  28.07 
 
 		 1108 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  31.32 
 
 		 556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  29.17 
 
 		 1139 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  27.04 
 
 		 1092 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  29.02 
 
 		 1114 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  29.08 
 
 		 1108 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  27.85 
 
 		 1099 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  28.8 
 
 		 1098 aa  197  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  28.88 
 
 		 1098 aa  196  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  28.88 
 
 		 1130 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  28.97 
 
 		 551 aa  194  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  28.24 
 
 		 1119 aa  194  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  28.6 
 
 		 1105 aa  193  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 529 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  26.93 
 
 		 1088 aa  191  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  26.92 
 
 		 1088 aa  191  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  26.93 
 
 		 1088 aa  191  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 558 aa  191  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  45.05 
 
 		 258 aa  190  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  27.85 
 
 		 1111 aa  190  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  27.02 
 
 		 1152 aa  190  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  26.87 
 
 		 1112 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.42 
 
 		 1085 aa  190  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  27.02 
 
 		 1088 aa  190  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  28.32 
 
 		 1100 aa  189  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  26.01 
 
 		 1110 aa  189  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  28.57 
 
 		 1113 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  29.3 
 
 		 559 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  28.06 
 
 		 1116 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0589  glycosidases-like  30.87 
 
 		 705 aa  187  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.361866  normal  0.0110561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  27.43 
 
 		 1116 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  29.96 
 
 		 553 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  27.43 
 
 		 1105 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  27.31 
 
 		 1137 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  27.52 
 
 		 553 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  27.9 
 
 		 1098 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  27.9 
 
 		 549 aa  186  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  29.08 
 
 		 553 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  30.18 
 
 		 558 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  27.17 
 
 		 1137 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  26.73 
 
 		 1136 aa  185  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  27.08 
 
 		 1104 aa  185  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 533 aa  185  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  26.89 
 
 		 548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 1138 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  29.94 
 
 		 554 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  27.13 
 
 		 1121 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 		 541 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  27.54 
 
 		 572 aa  184  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  27.45 
 
 		 606 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  29.69 
 
 		 558 aa  184  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  28.54 
 
 		 552 aa  184  8.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  29.56 
 
 		 554 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  25.89 
 
 		 1154 aa  183  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  27.69 
 
 		 572 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  26.15 
 
 		 1137 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  28.06 
 
 		 538 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  27.69 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  27.56 
 
 		 537 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  26.76 
 
 		 1088 aa  183  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  26.3 
 
 		 536 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  29.6 
 
 		 558 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  26.15 
 
 		 1137 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  26.15 
 
 		 1137 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  28.16 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  28.12 
 
 		 562 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  25 
 
 		 1109 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  26.09 
 
 		 1154 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  27.19 
 
 		 964 aa  182  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  27.22 
 
 		 537 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  27.55 
 
 		 568 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 544 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  26.64 
 
 		 1100 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  28.7 
 
 		 558 aa  181  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  26.1 
 
 		 1109 aa  181  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>