30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0640 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  62.9 
 
 		 63 aa  82  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  68.33 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  68.33 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  43.33 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  47.92 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  38.71 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  37.7 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  29.51 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.5 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  40.38 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  38.71 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 76 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  31.58 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  29.03 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  39.22 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 59 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2955  preprotein translocase, SecE subunit  37.25 
 
 		 59 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>