More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0628 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  100 
 
 
307 aa  609  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  69.16 
 
 
309 aa  441  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  62.71 
 
 
321 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  62.71 
 
 
321 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.78 
 
 
290 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 
149 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
142 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0092  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.305697  hitchhiker  0.00140915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1291  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 
139 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2146  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
139 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3799  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
140 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000337486  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
142 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
139 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2358  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.25 
 
 
494 aa  82.8  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.890412  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  33.08 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.64 
 
 
495 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  33.55 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
488 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  34.65 
 
 
154 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  33.33 
 
 
137 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  35.45 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.81 
 
 
499 aa  73.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  32.41 
 
 
242 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  31.75 
 
 
137 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  36.07 
 
 
149 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.06 
 
 
490 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
137 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  34.96 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  34.4 
 
 
141 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.61 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  29.6 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  26.72 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0653  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.04 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.53 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  26.71 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  27.33 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  27.14 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.61 
 
 
485 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.61 
 
 
485 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40 
 
 
488 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  28.81 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  33.59 
 
 
879 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.61 
 
 
485 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  33.59 
 
 
879 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  26.62 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.59 
 
 
612 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  36.15 
 
 
769 aa  69.3  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.61 
 
 
489 aa  69.3  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  26.62 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  26.39 
 
 
383 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  32.23 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  26 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
155 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  36.04 
 
 
143 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  34.15 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  38.84 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.26 
 
 
155 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  32.43 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  36.04 
 
 
143 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  26.62 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  36.67 
 
 
710 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  39.02 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.54 
 
 
577 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  34.09 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  31.53 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.07 
 
 
903 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  26.62 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  31.97 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  26.62 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  25.18 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  26.9 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  27.35 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  36.94 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  30.88 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.61 
 
 
483 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  28.03 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.34 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  32 
 
 
593 aa  65.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  25.53 
 
 
427 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  29.91 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.09 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.04 
 
 
488 aa  65.9  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  38.14 
 
 
865 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.61 
 
 
487 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.88 
 
 
873 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  33.09 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 
231 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  30.15 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
152 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  24.23 
 
 
428 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  24.26 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  29.71 
 
 
904 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  28.81 
 
 
262 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>