More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0583 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0583  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 
131 aa  257  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1319  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  51.68 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0212  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  52.11 
 
 
132 aa  120  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0210  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  51.75 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1365  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  45.38 
 
 
125 aa  101  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0208474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0799  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.44 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  38.89 
 
 
633 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  40.48 
 
 
596 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1491  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.93 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157118 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0700  biotin/lipoyl attachment protein  37.59 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0293  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.3 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1433  biotin carboxyl carrier protein  33.09 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  36.51 
 
 
590 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  37.88 
 
 
599 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  36.51 
 
 
590 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  36.51 
 
 
590 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  41.67 
 
 
613 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2540  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  38.17 
 
 
626 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.391908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1343  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.76 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  34.03 
 
 
609 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  39.84 
 
 
599 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  34.88 
 
 
597 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0337  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.05 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1155  biotin/lipoyl attachment  33.85 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.849643  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0319  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.05 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  35.61 
 
 
608 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  50 
 
 
690 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  37.01 
 
 
602 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05850  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.61 
 
 
591 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1591  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.84 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000447917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  35.66 
 
 
595 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1419  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.89 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.185754  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6688  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.83 
 
 
169 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  32.87 
 
 
606 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  38.1 
 
 
601 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  32.87 
 
 
607 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  34.65 
 
 
611 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  37.3 
 
 
604 aa  69.3  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  34.78 
 
 
1144 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  37.9 
 
 
604 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0555  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.99 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0730  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  47.89 
 
 
588 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  34.65 
 
 
611 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  36.51 
 
 
592 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1126  oxaloacetate decarboxylase  34.85 
 
 
607 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1740  hypothetical protein  36.36 
 
 
596 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.407057 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04462  pyruvate carboxylase (Eurofung)  49.33 
 
 
1196 aa  68.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736357  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  38.1 
 
 
603 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  38.54 
 
 
655 aa  68.6  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  34.65 
 
 
589 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  42.42 
 
 
592 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  50 
 
 
594 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1250  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  48.65 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3163  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  34.13 
 
 
669 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3000  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  34.13 
 
 
669 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  49.23 
 
 
690 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  36.64 
 
 
617 aa  67  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3659  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  41.05 
 
 
649 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00262153  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4375  pyruvate carboxylase  46.27 
 
 
1153 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  33.07 
 
 
567 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
599 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  37.5 
 
 
598 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4063  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.48 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49520  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.06 
 
 
658 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  49.25 
 
 
1148 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
607 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1729  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  35.38 
 
 
610 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0964  biotin/lipoyl attachment  37.01 
 
 
602 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0659271  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3094  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding protein  34.25 
 
 
611 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  45.95 
 
 
1090 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  34.65 
 
 
591 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2123  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding protein  45.83 
 
 
592 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3665  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  44.16 
 
 
650 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243321  hitchhiker  0.000000000183935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  43.16 
 
 
582 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0269  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.25 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0604  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.66 
 
 
601 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2442  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  52.24 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  45.45 
 
 
589 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  50.77 
 
 
569 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  45.45 
 
 
589 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2575  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  36.22 
 
 
613 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  45.45 
 
 
594 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  50.77 
 
 
569 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2669  pyruvate carboxylase  30.89 
 
 
1164 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  49.23 
 
 
569 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  45.45 
 
 
589 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  45.45 
 
 
591 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
611 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  45.45 
 
 
591 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  45.45 
 
 
588 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  45.45 
 
 
589 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0280  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  45 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0253037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4003  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  32.28 
 
 
667 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.666441  normal  0.37304 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1819  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  32.09 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  43.94 
 
 
604 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2390  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  30.08 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158727  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  48.48 
 
 
1147 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1619  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  30.65 
 
 
581 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0258  biotin/lipoyl attachment protein  45 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.63102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  47.76 
 
 
1148 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>