More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0566 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0566  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
256 aa  494  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  61.33 
 
 
256 aa  328  4e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  61.33 
 
 
256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0372  ornithine carbamoyltransferase  63.14 
 
 
261 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.19 
 
 
261 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00123252  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.22 
 
 
260 aa  234  9e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 
267 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.53 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.07 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  44.07 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  44.07 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  44.07 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  44.07 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.07 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.68 
 
 
266 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.68 
 
 
266 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  43.64 
 
 
266 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  43.35 
 
 
266 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  44.25 
 
 
257 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.68 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  40.66 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.3 
 
 
268 aa  198  7e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.26 
 
 
257 aa  197  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.61 
 
 
256 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  41.74 
 
 
266 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  42.51 
 
 
271 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.84 
 
 
270 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  43.56 
 
 
256 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  44.2 
 
 
273 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  44.16 
 
 
273 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  43.11 
 
 
256 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  42.8 
 
 
266 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
264 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.84 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  42.74 
 
 
273 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2225  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  41.63 
 
 
266 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.45 
 
 
262 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.89 
 
 
267 aa  186  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.84 
 
 
256 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  41.49 
 
 
272 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  44.21 
 
 
288 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  37.97 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1141  hypothetical protein  44.07 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1146  hypothetical protein  44.07 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  43.16 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  40.08 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.85 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
271 aa  181  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  39.83 
 
 
293 aa  181  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.74 
 
 
273 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.16 
 
 
284 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.91 
 
 
266 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
269 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  39.29 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  41.52 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  39.29 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.97 
 
 
281 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.97 
 
 
281 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
281 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
271 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
271 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
271 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.07 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  39.3 
 
 
271 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  39.3 
 
 
271 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  39.3 
 
 
271 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  39.3 
 
 
271 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.07 
 
 
256 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.59 
 
 
281 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 
259 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.62 
 
 
265 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
271 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  40.27 
 
 
272 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  41.15 
 
 
274 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
272 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.74 
 
 
260 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  39.66 
 
 
287 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  38.55 
 
 
271 aa  175  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
272 aa  174  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  38.19 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  41.95 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  39.27 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  36.8 
 
 
276 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1338  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.9 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.116682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1323  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.9 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1300  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.9 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.715844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1961  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.9 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1637  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.71 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  42.4 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1345  Ornithine carbamoyltransferase  40.25 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.593277  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  38.96 
 
 
273 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.33 
 
 
276 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  39.37 
 
 
244 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  38.77 
 
 
270 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>