142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0549 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0549  OsmC family protein  100 
 
 
147 aa  299  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0851  OsmC family protein  72.86 
 
 
141 aa  228  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0008  OsmC family protein  65.44 
 
 
138 aa  191  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0008  OsmC family protein  63.97 
 
 
138 aa  188  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  42.64 
 
 
142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  42.98 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1272  OsmC family protein  45.04 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.923187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2637  OsmC family protein  42.03 
 
 
158 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0425  OsmC family protein  39.44 
 
 
140 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0458  OsmC family protein  39.44 
 
 
140 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0455  OsmC family protein  39.44 
 
 
140 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4778  OsmC family protein  39.44 
 
 
140 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2047  OsmC family protein  42.31 
 
 
138 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00638742  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0597  OsmC family protein  48 
 
 
129 aa  105  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3942  OsmC family protein  38.73 
 
 
140 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08380  hypothetical protein  40.14 
 
 
140 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000457395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46090  OsmC family protein  38.03 
 
 
140 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0794  hypothetical protein  40.14 
 
 
140 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0597  OsmC/Ohr family protein  40.14 
 
 
140 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5110  OsmC-like protein  38.46 
 
 
140 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4576  OsmC-like protein  38.73 
 
 
140 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1434  OsmC family protein  41.27 
 
 
138 aa  99  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0451  OsmC/Ohr family protein  38.52 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00446662  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  37.04 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0380  OsmC-like protein  35.86 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  0.204016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1750  OsmC/Ohr family protein  36.3 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  39.1 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2833  OsmC family protein  38.93 
 
 
150 aa  94  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3551  OsmC family protein  37.31 
 
 
140 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0756  hypothetical protein  37.04 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  37.59 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  39.37 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0525  OsmC family protein  35.43 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0914  OsmC-like protein  37.59 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3241  OsmC/Ohr family protein  34.56 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2842  OsmC family protein  34.56 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324994  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0342  OsmC-like protein  34.07 
 
 
138 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0648  OsmC-like protein  36.43 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000386556  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0953  OsmC-like protein  37.4 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0605  putative OsmC-like protein  37.88 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000773894  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3355  OsmC family protein  36.72 
 
 
140 aa  87  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566205  hitchhiker  0.00000500952 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3860  OsmC family protein  34.81 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2420  OsmC/Ohr family protein  37.12 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3422  OsmC/Ohr family protein  37.12 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3763  OsmC-like protein  36.72 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759493  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1232  OsmC/Ohr family protein  37.12 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0194  OsmC-like protein  36.72 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0197552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0571  OsmC family protein  36.72 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000750944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0677  OsmC family protein  36.72 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000026959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0336  OsmC/Ohr family protein  37.12 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3124  hypothetical protein  36.97 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200026  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1197  OsmC/Ohr family protein  37.12 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3415  OsmC/Ohr family protein  37.12 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00702998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2607  OsmC/Ohr family protein  37.12 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2780  OsmC family protein  40.57 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0644  OsmC family protein  36.72 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000216559  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0597  OsmC family protein  36.72 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000609045  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1855  OsmC family protein  36.59 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02740  OsmC family protein  37.59 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2706  OsmC family protein  36.72 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.935729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2565  OsmC family protein  35.94 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928304  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0111  OsmC family protein  37.6 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.174178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1486  OsmC-like protein  33.59 
 
 
147 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320434  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3380  OsmC/Ohr family protein  37.12 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0489  hypothetical protein  36.15 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00109519  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1231  OsmC family protein  34.33 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000016936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2356  OsmC family protein  33.58 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0466  OsmC-like protein  34.88 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604896  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  36.92 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000280458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0365  OsmC family protein  35.38 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000167168  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0380  OsmC family protein  35.38 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00128775  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1013  OsmC family protein  31.88 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0408  OsmC-like protein  36.36 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000203576  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2834  OsmC family protein  35.83 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0153  OsmC family protein  32.81 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.818803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0680  OsmC family protein  34.68 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  0.178697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1086  OsmC family protein  34.68 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0294  hypothetical protein  32.39 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.618056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0659  OsmC family protein  34.68 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0732219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3731  OsmC family protein  33.61 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.159888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2244  OsmC-like protein  40 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.990359  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3852  hypothetical protein  32.09 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0930  OsmC family protein  33.87 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169385  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1163  OsmC family protein  31.88 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0370  hypothetical protein  32.86 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0520  OsmC family protein  34.68 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0674  OsmC family protein  36.28 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.951893  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4031  hypothetical protein  31.34 
 
 
135 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0744  OsmC-like protein  31.58 
 
 
152 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4579  hypothetical protein  34.07 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329282  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5684  OsmC family protein  33.06 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000158569  normal  0.43813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0861  OsmC family protein  35.48 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458786  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2006  hypothetical protein  32.85 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2309  OsmC-like protein  32.85 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.87552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0732  OsmC-like protein  32.31 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0631  OsmC family protein  32.12 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0203  OsmC family protein  31.5 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0158527  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0645  OsmC family protein  32.26 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0249  hypothetical protein  31.85 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01078  putative inner membrane protein  37.5 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>