More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0541 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
343 aa  696  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  52.14 
 
 
353 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  47.77 
 
 
349 aa  289  5e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  47.45 
 
 
349 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  48.24 
 
 
345 aa  235  9e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  36.72 
 
 
348 aa  189  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  37.67 
 
 
336 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  37.63 
 
 
339 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  36.62 
 
 
353 aa  175  1e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  3.24218e-10 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.28 
 
 
363 aa  164  2e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  31.45 
 
 
360 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  38.04 
 
 
331 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  32.85 
 
 
366 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  36.33 
 
 
336 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  31.99 
 
 
380 aa  147  2e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52679e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  30.06 
 
 
350 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  30.7 
 
 
351 aa  146  4e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  34.97 
 
 
350 aa  146  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  32.69 
 
 
339 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 
386 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  31.27 
 
 
349 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  33.02 
 
 
342 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  36.36 
 
 
349 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 
348 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  31.14 
 
 
338 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  34.07 
 
 
345 aa  139  5e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  31.63 
 
 
308 aa  139  5e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.98345e-05  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  32.29 
 
 
344 aa  139  5e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.88784e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  30.03 
 
 
339 aa  139  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  1.41849e-06 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  33.9 
 
 
333 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.94 
 
 
343 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  32.92 
 
 
297 aa  136  7e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  33.46 
 
 
312 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.94 
 
 
336 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  30.56 
 
 
355 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.88 
 
 
313 aa  134  2e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 
335 aa  134  2e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  33.84 
 
 
336 aa  133  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  31.67 
 
 
346 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  30.71 
 
 
310 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  31.85 
 
 
379 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  30.6 
 
 
305 aa  133  4e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 
331 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  35.38 
 
 
306 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 
381 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.33 
 
 
328 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  34.83 
 
 
344 aa  132  7e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.72 
 
 
341 aa  132  8e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  28.36 
 
 
335 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
301 aa  132  1e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.23 
 
 
349 aa  132  1e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  32.89 
 
 
346 aa  131  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
302 aa  131  2e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  32.92 
 
 
301 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  32.92 
 
 
301 aa  130  4e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  29.7 
 
 
371 aa  129  5e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  31.68 
 
 
337 aa  128  1e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30 
 
 
322 aa  127  2e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  30.49 
 
 
338 aa  127  2e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  34.16 
 
 
309 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  30.4 
 
 
337 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.71 
 
 
332 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  33.62 
 
 
330 aa  127  4e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  31.23 
 
 
331 aa  127  4e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  28.93 
 
 
362 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.81 
 
 
350 aa  125  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  30.56 
 
 
329 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.36 
 
 
361 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  27.42 
 
 
338 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  30 
 
 
368 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  30 
 
 
365 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 
348 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 
348 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 
348 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 
348 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  29.89 
 
 
341 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  32.26 
 
 
347 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 
417 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  29.93 
 
 
331 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  29.86 
 
 
279 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  32.42 
 
 
316 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  28.81 
 
 
352 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  27.49 
 
 
370 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.79 
 
 
350 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  29.63 
 
 
345 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  27.19 
 
 
352 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  30.45 
 
 
350 aa  122  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.97 
 
 
317 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  27.19 
 
 
352 aa  122  1e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  29.33 
 
 
338 aa  120  2e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  31.33 
 
 
347 aa  121  2e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  29.1 
 
 
370 aa  121  2e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.51305e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  33.46 
 
 
330 aa  121  2e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  28.37 
 
 
340 aa  120  4e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.59 
 
 
347 aa  120  4e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 
350 aa  119  5e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  27.54 
 
 
374 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  26.74 
 
 
374 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  28.47 
 
 
327 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  27.3 
 
 
335 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>