More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0507 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  691    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  30.79 
 
 
329 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  26.53 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 
356 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  26.35 
 
 
338 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 
340 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  23.62 
 
 
344 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 
340 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 
338 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.16 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  25.98 
 
 
342 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.32 
 
 
313 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  26.1 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2353  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
310 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 
873 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  23.57 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 
307 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  22.44 
 
 
337 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  21.4 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0354  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 
377 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.880417 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.63 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  21.68 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  25.41 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  21.64 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  21.74 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.15 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3033  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  21.15 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 
515 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 
434 aa  69.7  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3312  hypothetical protein  22.32 
 
 
465 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  26.12 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  22.3 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  21.49 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  21.65 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.93 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0776  Fe-S oxidoreductase-like  23.4 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  22.56 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  23.17 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3305  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.93 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  27.54 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 
480 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  25.68 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  26.35 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  26.35 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 
474 aa  66.2  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  26.35 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  26.35 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  26.35 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  26.01 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.08 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.34 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  21.59 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  31.73 
 
 
301 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14401  hypothetical protein  24.66 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.32313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  26.01 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  22.11 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.74 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  20.82 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 
471 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 
427 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  22.81 
 
 
482 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 
397 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  29.37 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 
513 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 
482 aa  63.2  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
451 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  23.4 
 
 
349 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>