More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0504 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 180 aa  352  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  60.11 
 
 		 181 aa  227  8e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  59.12 
 
 		 179 aa  205  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  59.12 
 
 		 179 aa  205  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0357  50S ribosomal protein L10  36.52 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.395491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  39.43 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  38.2 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  36.52 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  38.98 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  35.96 
 
 		 173 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  37.29 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  39.2 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.75 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  36.36 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  35.75 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  37.02 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  38.12 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  37.08 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  36 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  36.16 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  34.46 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  35.44 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  34.27 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  32.2 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  34.46 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  36.21 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  34.36 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  32.02 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  32.2 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  34.08 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  32.77 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 173 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  31.84 
 
 		 174 aa  98.6  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  33.15 
 
 		 189 aa  97.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  31.64 
 
 		 173 aa  97.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  31.64 
 
 		 173 aa  97.4  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  31.07 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  32.4 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  32.22 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  32.2 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  40.85 
 
 		 212 aa  95.5  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  35.63 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  34.08 
 
 		 175 aa  94.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  32.39 
 
 		 171 aa  94.7  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  39.72 
 
 		 181 aa  94.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  94.4  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  33.52 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  31.82 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  33.15 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  30.68 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  30.95 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  35 
 
 		 176 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  32.02 
 
 		 176 aa  90.9  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 175 aa  90.9  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  31.49 
 
 		 181 aa  90.9  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  32.78 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  32.39 
 
 		 256 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  31.84 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  29.78 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  31.25 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  30.51 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  29.78 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  32.97 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  34.21 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  29.89 
 
 		 174 aa  88.2  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  32.35 
 
 		 174 aa  88.2  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  32.2 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  38.3 
 
 		 173 aa  87.8  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  31.07 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  34.16 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  34.16 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  34.16 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  35.62 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  32.14 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  31.61 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  32.76 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  32.76 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 		 175 aa  85.1  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  32.76 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>