More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0487 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
240 aa  478  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1155  alpha/beta hydrolase fold  36.68 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.230861  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1048  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 
239 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1207  Alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
245 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1214  hypothetical protein  35.5 
 
 
239 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0887  hypothetical protein  34.78 
 
 
239 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0817  hypothetical protein  34.78 
 
 
239 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.467529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
314 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0636  putative hydrolase, alpha/beta fold family  35.68 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.208223  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0810  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 
264 aa  109  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0122335  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0597  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.537366  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0930  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
353 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.262711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
297 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 
456 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  27 
 
 
462 aa  104  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  29.08 
 
 
275 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  31.15 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  31.15 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  31.15 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  27.76 
 
 
462 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  30.92 
 
 
257 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  28.93 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
279 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
279 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 
340 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  23.6 
 
 
453 aa  92.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 
340 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 
340 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
299 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
333 aa  91.7  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  28.69 
 
 
279 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  28.1 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
345 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
340 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
314 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
279 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  27.69 
 
 
279 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
504 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
350 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
340 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  27.57 
 
 
279 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
284 aa  85.1  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  24.81 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.69 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  23.66 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.69 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.69 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
295 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  26.67 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  25.67 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.27 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  23.41 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  24.91 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  27.62 
 
 
290 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
257 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  24.6 
 
 
308 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.16 
 
 
562 aa  79  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 
405 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
273 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  23.81 
 
 
300 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.59 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  26.03 
 
 
294 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  26.25 
 
 
294 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
294 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
294 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.62 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
312 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>