199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0475 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0475  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 317 aa  635    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00102618  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  37.18 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 206 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  33.01 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  33.01 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.62 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  31.86 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  31.31 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  31.63 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  31.63 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  32.04 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  33 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  30.39 
 
 		 199 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  33.33 
 
 		 495 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  26.36 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  30.6 
 
 		 1160 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  32.63 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  31.91 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  31.91 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  31.91 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 733 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 216 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  32.93 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  29.09 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  29.81 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 		 669 aa  53.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 196 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 245 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  31 
 
 		 191 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  30.85 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 596 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  30.85 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  37.78 
 
 		 522 aa  52.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.13 
 
 		 448 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  32.05 
 
 		 226 aa  52.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  34.18 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  37.36 
 
 		 405 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4448  lytic transglycosylase, catalytic  31.37 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  26.49 
 
 		 638 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  29.55 
 
 		 189 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  30.94 
 
 		 202 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  25 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  31.68 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  36.36 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  30.85 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  30.85 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  30.85 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  30.61 
 
 		 198 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  35.63 
 
 		 544 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  30.85 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 669 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 570 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  27.1 
 
 		 218 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  25.77 
 
 		 451 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  35.79 
 
 		 556 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  31.91 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  28.05 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 561 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  29.46 
 
 		 154 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  31.87 
 
 		 618 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  27.27 
 
 		 198 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  28.24 
 
 		 146 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  27.84 
 
 		 482 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 208 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  32.1 
 
 		 370 aa  49.7  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  29.81 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.09 
 
 		 617 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 238 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  32.53 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  24.77 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  26 
 
 		 245 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  34.23 
 
 		 222 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  26.83 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  32.95 
 
 		 283 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  39.74 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  29 
 
 		 555 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  32.05 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>