More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0418 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 326 aa  665    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  78.37 
 
 		 321 aa  520  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  59.82 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  57.98 
 
 		 332 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  59.08 
 
 		 333 aa  404  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  58.15 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  58.15 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  61.92 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  56.92 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  58.46 
 
 		 332 aa  398  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  59.06 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  54.66 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  55.84 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  53.85 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  53.85 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  52.37 
 
 		 327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 		 327 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  56.17 
 
 		 324 aa  360  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 328 aa  360  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  55.08 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  55.11 
 
 		 327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 328 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 332 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  54.27 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  53.44 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  52.05 
 
 		 327 aa  345  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 328 aa  346  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  50.94 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  51.53 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  52.15 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 		 329 aa  339  5e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  52.13 
 
 		 330 aa  338  8e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  51.69 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  51.69 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  50.63 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  52.83 
 
 		 329 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  52.98 
 
 		 321 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  51.23 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  52.98 
 
 		 324 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  52.98 
 
 		 321 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  50.92 
 
 		 330 aa  331  9e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  50.92 
 
 		 330 aa  331  9e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  51.85 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 		 326 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  51.85 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  50.61 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  45.85 
 
 		 353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 330 aa  325  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 333 aa  324  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  47.37 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 329 aa  322  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 349 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  47.81 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  50.94 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  46.54 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  47.34 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  45.94 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  47.19 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 330 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 330 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 330 aa  315  8e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 330 aa  315  9e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  47.92 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  44.97 
 
 		 329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 341 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  45.91 
 
 		 329 aa  312  4.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  48.73 
 
 		 328 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 		 326 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  48.58 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  45.62 
 
 		 331 aa  309  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  43.75 
 
 		 329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 332 aa  308  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 327 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  45.37 
 
 		 327 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  44.48 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  48.29 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 328 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  48.28 
 
 		 335 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 329 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>