49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0361 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 482 aa  929    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3133  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 507 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0165717  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2969  O-antigen and teichoic acid-like export protein  21.65 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 435 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 506 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.84 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  25.1 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.97 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.04 
 
 		 508 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.65 
 
 		 517 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.5 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  25.09 
 
 		 494 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  20.51 
 
 		 488 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 507 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 505 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.79 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  21.28 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  18.4 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.33 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  29.89 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 497 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2606  hypothetical protein  17.95 
 
 		 524 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  24.29 
 
 		 495 aa  43.5  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  23.52 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 503 aa  43.5  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 484 aa  43.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>