More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0305 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1064  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  83.84 
 
 
427 aa  740  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0305  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  100 
 
 
427 aa  875  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.256409  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1790  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  67.48 
 
 
416 aa  587  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.152655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1731  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  67.23 
 
 
416 aa  565  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1583  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  61.47 
 
 
431 aa  511  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0805  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  57.18 
 
 
419 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4511  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  57.38 
 
 
419 aa  487  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1722  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  54.17 
 
 
417 aa  466  1e-130  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1713  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  53.52 
 
 
420 aa  460  1e-128  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.494068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2689  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  54.11 
 
 
421 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.654737  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0724  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.9 
 
 
421 aa  454  1e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4385  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  52.42 
 
 
421 aa  452  1e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  53.88 
 
 
439 aa  448  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2006  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  51.96 
 
 
417 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3363  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.13 
 
 
437 aa  446  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39653  hitchhiker  3.59206e-06 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0480  glutamate dehydrogenase (NAD(P)+) oxidoreductase protein  53.63 
 
 
433 aa  446  1e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0356  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.88 
 
 
433 aa  447  1e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0183  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.72 
 
 
418 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.058595  normal  0.571657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0456  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal:Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  51.87 
 
 
435 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0188  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  51.05 
 
 
433 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0596  glutamate dehydrogenase (NADP)  53.13 
 
 
440 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1961  response regulator receiver protein  51.45 
 
 
549 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0371  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.87 
 
 
433 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3239  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  52.88 
 
 
438 aa  441  1e-122  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0045949  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3754  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.88 
 
 
428 aa  439  1e-122  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2473  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.63 
 
 
424 aa  439  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0589  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.88 
 
 
428 aa  439  1e-122  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.374575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2715  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.38 
 
 
428 aa  439  1e-122  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1591  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  53.37 
 
 
416 aa  440  1e-122  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0398  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  51.87 
 
 
435 aa  441  1e-122  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4808  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.38 
 
 
423 aa  440  1e-122  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0563  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  52.63 
 
 
428 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.794737  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0668  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  52.63 
 
 
428 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0185  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.63 
 
 
428 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.484699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0353  glutamate dehydrogenase  52.88 
 
 
434 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1212  glutamate dehydrogenase  52.88 
 
 
434 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3397  putative glutamate dehydrogenase  52.88 
 
 
434 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.972567  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3432  putative glutamate dehydrogenase  52.88 
 
 
434 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1505  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  55.53 
 
 
445 aa  435  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2574  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.38 
 
 
430 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0635  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.63 
 
 
428 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400076  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2439  glutamate dehydrogenase  52.88 
 
 
434 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0211  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.71 
 
 
434 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1224  glutamate dehydrogenase  52.38 
 
 
434 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3435  glutamate dehydrogenase  52.88 
 
 
434 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.373293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3997  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  51.83 
 
 
415 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2623  glutamate dehydrogenase  52.88 
 
 
434 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2327  glutamate dehydrogenase (NADP)  52.1 
 
 
428 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3745  putative glutamic dehyrogenase  51.88 
 
 
433 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0135  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  51.37 
 
 
434 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1230  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.37 
 
 
424 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0153  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  51.37 
 
 
434 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1702  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  51.37 
 
 
433 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2721  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal:Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerization region  53.12 
 
 
427 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4115  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.99 
 
 
422 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.764753  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0389  glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  55.42 
 
 
425 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.162491  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0811  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.79 
 
 
417 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3761  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.75 
 
 
432 aa  425  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.060443  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0494  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  54.64 
 
 
440 aa  428  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3799  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  53.57 
 
 
428 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.16161e-07  hitchhiker  3.63734e-11 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2183  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.63 
 
 
428 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0550641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1546  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  53.57 
 
 
428 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.59966e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1973  glutamate dehydrogenase (NAD/NADP)  49.02 
 
 
416 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1626  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  51.24 
 
 
427 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1652  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  53.32 
 
 
428 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.95383e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2322  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.27 
 
 
425 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.70061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1617  glutamate dehydrogenase  53.32 
 
 
428 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  3.88705e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1401  glutamate dehydrogenase  53.32 
 
 
428 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.29011e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1413  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.06 
 
 
428 aa  418  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.0312e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1511  glutamate dehydrogenase  53.32 
 
 
428 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.26208e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1585  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  53.32 
 
 
428 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.25927e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1373  glutamate dehydrogenase  53.32 
 
 
428 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.02458e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5648  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.97 
 
 
424 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1372  glutamate dehydrogenase  53.32 
 
 
428 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  3.83357e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0445  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.66 
 
 
423 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1992  glutamate dehydrogenase  52.12 
 
 
424 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4390  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.96 
 
 
418 aa  417  1e-115  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252025  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2404  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.75 
 
 
427 aa  417  1e-115  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00345076 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1524  glutamate dehydrogenase  52.12 
 
 
424 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1936  glutamate dehydrogenase  52.12 
 
 
424 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.957815  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3400  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  51.21 
 
 
424 aa  417  1e-115  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1339  glutamate dehydrogenase  52.12 
 
 
424 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.919787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1485  glutamate dehydrogenase (NAD)  48.66 
 
 
416 aa  416  1e-115  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.491869 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0167  glutamate dehydrogenase (NAD/NADP)  49.64 
 
 
442 aa  417  1e-115  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.426909  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1932  glutamate dehydrogenase  52.12 
 
 
424 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1333  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.12 
 
 
436 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08360  glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase  50.37 
 
 
459 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0598327 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00880  glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase  49.28 
 
 
426 aa  413  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1214  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.32 
 
 
427 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.00096e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1158  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.27 
 
 
424 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1389  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.27 
 
 
428 aa  411  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1074  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.12 
 
 
428 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  50.49 
 
 
712 aa  411  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1201  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.65 
 
 
435 aa  409  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  6.45757e-08  hitchhiker  6.00855e-06 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2621  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.52 
 
 
419 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3619  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.58 
 
 
424 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770493  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0546  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  51.25 
 
 
414 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3380  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.56 
 
 
431 aa  408  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0997  glutamate dehydrogenase  50.49 
 
 
413 aa  406  1e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0706  glutamate dehydrogenase (NAD/NADP)  47.8 
 
 
416 aa  407  1e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.110428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>