More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0253 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  871    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  73.52 
 
 		 426 aa  651    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  68.63 
 
 		 425 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  68.63 
 
 		 425 aa  593  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 424 aa  561  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 424 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 420 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 423 aa  507  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 424 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 424 aa  501  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 424 aa  501  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 424 aa  501  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 424 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 423 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 424 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  55.63 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 422 aa  488  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 424 aa  474  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 423 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 422 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 425 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 438 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 426 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>