More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0244 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  100 
 
 		 147 aa  293  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  71.92 
 
 		 150 aa  225  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  71.92 
 
 		 150 aa  225  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  73.29 
 
 		 149 aa  224  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  61.97 
 
 		 150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  56.85 
 
 		 155 aa  173  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  58.9 
 
 		 152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  59.33 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  58.57 
 
 		 155 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  60 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  55.17 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  60.31 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  56.25 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  57.86 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  52.86 
 
 		 159 aa  163  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  56.55 
 
 		 151 aa  163  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  56.85 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  55.48 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  55 
 
 		 161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  55 
 
 		 155 aa  159  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  55 
 
 		 155 aa  159  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  56.55 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  52.14 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  55 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 159 aa  156  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 156 aa  156  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 152 aa  156  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  53.64 
 
 		 156 aa  155  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  52.11 
 
 		 157 aa  153  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 157 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 160 aa  153  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  52.9 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  52.52 
 
 		 157 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 154 aa  150  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  55.64 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 160 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  52.41 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 157 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  50 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  53.96 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  52.9 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  51.06 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  52.86 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 167 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  50.72 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  47.48 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  48.2 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  53.52 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>