More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0206 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.44 
 
 
611 aa  672  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.70708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  54.89 
 
 
616 aa  640  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.53226e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  54.49 
 
 
627 aa  641  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.1 
 
 
610 aa  881  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.98 
 
 
637 aa  636  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.21 
 
 
630 aa  666  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.78 
 
 
614 aa  989  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.27 
 
 
632 aa  637  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.7 
 
 
657 aa  637  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.85756e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.5 
 
 
639 aa  666  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.93 
 
 
639 aa  645  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0453  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.27 
 
 
653 aa  670  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.1 
 
 
610 aa  880  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.36 
 
 
607 aa  668  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.8 
 
 
645 aa  711  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.68 
 
 
630 aa  651  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.19838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.79 
 
 
615 aa  671  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
617 aa  1248  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.83 
 
 
630 aa  682  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.46 
 
 
620 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  52.8 
 
 
682 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  53.31 
 
 
614 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.35 
 
 
635 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.23168e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.39 
 
 
612 aa  628  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.55 
 
 
612 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.13 
 
 
608 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  54.06 
 
 
645 aa  626  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.72 
 
 
643 aa  627  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.48 
 
 
602 aa  624  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  53.54 
 
 
633 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.16 
 
 
608 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.86964e-12  hitchhiker  9.19555e-11 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  53.45 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  62.45 
 
 
654 aa  624  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  53.38 
 
 
633 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.41 
 
 
676 aa  621  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  53.38 
 
 
633 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  53.38 
 
 
633 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  53.38 
 
 
633 aa  621  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  53.71 
 
 
633 aa  621  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  53.38 
 
 
633 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.65 
 
 
616 aa  621  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.31 
 
 
653 aa  619  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  53.38 
 
 
633 aa  621  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.74 
 
 
651 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.38 
 
 
652 aa  615  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.8 
 
 
656 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.9 
 
 
671 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54 
 
 
679 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  52.98 
 
 
693 aa  615  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.47 
 
 
633 aa  618  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.49 
 
 
665 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  9.7295e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  52.7 
 
 
637 aa  615  1e-174  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.92 
 
 
673 aa  612  1e-174  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  7.47191e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.9 
 
 
672 aa  613  1e-174  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.17 
 
 
640 aa  612  1e-174  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.41 
 
 
621 aa  614  1e-174  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  3.90574e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.77 
 
 
599 aa  608  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  55.31 
 
 
656 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.78 
 
 
617 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.9937e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
685 aa  609  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.84 
 
 
601 aa  607  1e-172  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.05 
 
 
635 aa  607  1e-172  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.62887e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.68 
 
 
601 aa  607  1e-172  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.28 
 
 
682 aa  605  1e-172  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  61.39 
 
 
753 aa  605  1e-172  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.37 
 
 
645 aa  603  1e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.55 
 
 
652 aa  604  1e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.15 
 
 
640 aa  604  1e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  52.15 
 
 
647 aa  604  1e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50.74 
 
 
681 aa  604  1e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.72 
 
 
753 aa  603  1e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.33 
 
 
672 aa  603  1e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.93 
 
 
662 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  55.43 
 
 
652 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  51.82 
 
 
650 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  51.24 
 
 
613 aa  598  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.83 
 
 
640 aa  599  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.33 
 
 
647 aa  596  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 
637 aa  598  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  51.41 
 
 
626 aa  596  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.5 
 
 
641 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.64 
 
 
643 aa  595  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 
640 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.83 
 
 
631 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  1.61272e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.24 
 
 
759 aa  592  1e-168  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.66 
 
 
638 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  48.6 
 
 
641 aa  595  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 
640 aa  592  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
630 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  53.38 
 
 
640 aa  592  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.6 
 
 
641 aa  595  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  5.38209e-07  hitchhiker  1.71199e-08 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  51.46 
 
 
700 aa  592  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 
638 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
608 aa  594  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 
634 aa  594  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 
648 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.78 
 
 
750 aa  589  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  51.16 
 
 
613 aa  588  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
636 aa  590  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 
697 aa  591  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>