289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0185 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0185  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1654  hypothetical protein  54.9 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  40 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  37.66 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  35.03 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  35.03 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1366  hypothetical protein  38.16 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  35.03 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  36.48 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  35.03 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  32.69 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  38.93 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  34.39 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  36.02 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4518  protein of unknown function DUF163  33.12 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.600852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  35.44 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  32.08 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  31.65 
 
 		 154 aa  86.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  33.97 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  34.18 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  32.26 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  28.86 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  32.26 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  35 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  32.05 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  34.62 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  32.28 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  32.26 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  35 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf790  hypothetical protein  34.21 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  35.22 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  30.52 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  32.14 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  28.21 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  27.21 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  44.58 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  29.3 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  29.87 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  28.66 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  29.75 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00605  hypothetical protein  27.45 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2990  protein of unknown function DUF163  27.45 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000047133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3009  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000239477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00594  hypothetical protein  27.45 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000243444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0656  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000108281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0662  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0725  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121913  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  30.97 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0688  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154252  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  28.1 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  26.62 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  26.28 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  34.59 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  28.57 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  30.38 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  28.57 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  30.38 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  30.32 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  32.28 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  31.45 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0940  hypothetical protein  43.37 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  30.38 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  26.62 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  26.8 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  26.8 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  26.8 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  26.8 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>