More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0157 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  74.36 
 
 
202 aa  308  4e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  60.96 
 
 
193 aa  236  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  60.96 
 
 
193 aa  236  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.68 
 
 
205 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.61 
 
 
205 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0936  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.14 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.8 
 
 
227 aa  195  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1351  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.54 
 
 
226 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.39 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
235 aa  192  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.19 
 
 
210 aa  191  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  48.95 
 
 
226 aa  188  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.28 
 
 
238 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382173  normal  0.0633983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.52 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1556  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.81 
 
 
230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.199846  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.69 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.22 
 
 
264 aa  177  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.95 
 
 
199 aa  177  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.73 
 
 
186 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.7 
 
 
191 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.24 
 
 
300 aa  175  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.63 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.71 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1297  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.54 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.85 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.54 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.33 
 
 
264 aa  171  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.56 
 
 
189 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  46.99 
 
 
206 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.49 
 
 
190 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.13 
 
 
187 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.28 
 
 
273 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.13 
 
 
219 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.2 
 
 
295 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.2 
 
 
205 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.95 
 
 
245 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.71 
 
 
304 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.03 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.54 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0748398  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.79 
 
 
216 aa  165  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.67 
 
 
245 aa  164  6.9999999999999995e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.3 
 
 
259 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.4 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.59 
 
 
297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.15 
 
 
290 aa  161  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.62 
 
 
203 aa  161  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.03 
 
 
207 aa  160  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.11 
 
 
220 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  42.7 
 
 
233 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.09 
 
 
235 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.01 
 
 
208 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.51 
 
 
294 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.31 
 
 
191 aa  157  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  48.48 
 
 
189 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07891  Uracil-DNA glycosylase  47.16 
 
 
191 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.35108  hitchhiker  0.00776073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.97 
 
 
216 aa  155  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.02 
 
 
380 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  42.08 
 
 
224 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.44 
 
 
193 aa  155  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.55 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.7 
 
 
194 aa  154  6e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.15 
 
 
190 aa  154  9e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.02 
 
 
243 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.56 
 
 
276 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.77 
 
 
281 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.54 
 
 
253 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.78 
 
 
211 aa  152  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.4 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.67 
 
 
277 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.78 
 
 
301 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.62 
 
 
277 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  40.7 
 
 
264 aa  150  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.89 
 
 
260 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.44 
 
 
231 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.4 
 
 
210 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0440  uracil-DNA glycosylase  43.86 
 
 
275 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.11 
 
 
282 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  41.34 
 
 
195 aa  149  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  39.57 
 
 
274 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.25 
 
 
192 aa  149  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.62 
 
 
187 aa  149  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.78 
 
 
289 aa  148  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14331  Uracil-DNA glycosylase  42.94 
 
 
183 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  38.83 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  38.83 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.66 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.5 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  40.66 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.66 
 
 
358 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.67 
 
 
367 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0343  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.25 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.202316  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.67 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.38 
 
 
209 aa  145  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.81 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  40.68 
 
 
213 aa  145  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.46 
 
 
341 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.49 
 
 
330 aa  144  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>