More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0151 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  100 
 
 
283 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  57.29 
 
 
305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  56.94 
 
 
301 aa  325  6e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  54.28 
 
 
310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  56.84 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  49.18 
 
 
308 aa  279  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  46.18 
 
 
304 aa  266  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  43.93 
 
 
319 aa  248  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  46.71 
 
 
305 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  43.73 
 
 
285 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
310 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  44.24 
 
 
301 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 
294 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
301 aa  235  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  41.22 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  41.01 
 
 
301 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  44.37 
 
 
256 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 
280 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  43.31 
 
 
254 aa  225  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  41.84 
 
 
305 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.3 
 
 
327 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  41.67 
 
 
284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.32 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  40.94 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  41.72 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  41.01 
 
 
284 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  41.08 
 
 
303 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  40.13 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  40.29 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  40.46 
 
 
339 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  49.05 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  40.29 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  41.02 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.22 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  36.88 
 
 
314 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
297 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  40.67 
 
 
310 aa  209  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  41.01 
 
 
294 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  35.95 
 
 
312 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  36.31 
 
 
328 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 
324 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  38.21 
 
 
302 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  39.16 
 
 
309 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.67 
 
 
324 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  39.21 
 
 
289 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
299 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  35.65 
 
 
353 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
317 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.49 
 
 
317 aa  206  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  36.09 
 
 
306 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.14 
 
 
313 aa  205  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  37.66 
 
 
313 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  38.76 
 
 
320 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
308 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  37.22 
 
 
312 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  38.62 
 
 
300 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  37.3 
 
 
321 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  41.55 
 
 
290 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 
316 aa  202  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
312 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
306 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  36.84 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  44.95 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  42.92 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  38 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  38.03 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 
339 aa  199  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  39 
 
 
323 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.88 
 
 
316 aa  198  7e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  36.66 
 
 
320 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  35.22 
 
 
309 aa  198  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  38.08 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  36.96 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.08 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  36.49 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.39 
 
 
323 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  37.07 
 
 
305 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  47.69 
 
 
241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.33 
 
 
311 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  37.09 
 
 
307 aa  195  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  34.84 
 
 
308 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
300 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  41.55 
 
 
309 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 
308 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.58 
 
 
328 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.69 
 
 
316 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  38.41 
 
 
312 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  36.18 
 
 
332 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
331 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  35.37 
 
 
319 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  37.46 
 
 
311 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  36.12 
 
 
330 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>