More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0121 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  100 
 
 
360 aa  724    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.57 
 
 
363 aa  282  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.96 
 
 
432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0729  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.79 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000867503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.44 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.44 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.44 
 
 
411 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.44 
 
 
411 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.62 
 
 
411 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.82 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.59 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.1 
 
 
411 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.1 
 
 
411 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.1 
 
 
411 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.1 
 
 
411 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.1 
 
 
411 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  30.1 
 
 
411 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.1 
 
 
411 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.41 
 
 
411 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.82 
 
 
305 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.26 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.1 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  30.16 
 
 
314 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.42 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.72 
 
 
311 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.91 
 
 
305 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.13 
 
 
305 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.59 
 
 
304 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.67 
 
 
304 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.42 
 
 
304 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.43 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.72 
 
 
304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.51 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.67 
 
 
313 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.77 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.44 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.1 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.1 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.1 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.1 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.1 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.1 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.1 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.01 
 
 
300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.45 
 
 
444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.65 
 
 
313 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.77 
 
 
309 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.77 
 
 
309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1197  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.67 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  29.18 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  30.17 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.68 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.94 
 
 
444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  27.65 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.37 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.68 
 
 
435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.9 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1495  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.49 
 
 
303 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.19 
 
 
436 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1769  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.9 
 
 
311 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.68 
 
 
437 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.68 
 
 
437 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.68 
 
 
435 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.68 
 
 
437 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1382  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.55 
 
 
299 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0126255  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.78 
 
 
303 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.16 
 
 
308 aa  113  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5681  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.25 
 
 
325 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00753595  normal  0.0457266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0072  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.89 
 
 
307 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0056  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  30.35 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  25 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0529  dihydroorotate dehydrogenase  31.23 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5904  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.25 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.17 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09420  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  30.36 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.48 
 
 
322 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.64 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  30.99 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.83 
 
 
310 aa  110  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1663  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.89 
 
 
356 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000377649  hitchhiker  0.00130858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.16 
 
 
304 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  30.07 
 
 
321 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.21 
 
 
311 aa  109  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3426  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.63 
 
 
312 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0553  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.74 
 
 
309 aa  109  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1300  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.37 
 
 
307 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.74 
 
 
434 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.87 
 
 
436 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.79 
 
 
434 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.62 
 
 
304 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.79 
 
 
434 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
436 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.69 
 
 
297 aa  106  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.77 
 
 
320 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11880  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  28.01 
 
 
306 aa  106  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.0175843 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0296  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.13 
 
 
436 aa  106  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.31 
 
 
425 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1065  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.97 
 
 
307 aa  106  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.257669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1154  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.45 
 
 
295 aa  106  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43388  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1755  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.7 
 
 
305 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>