More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0099 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  61.7 
 
 
217 aa  246  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  59.79 
 
 
207 aa  236  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  58.73 
 
 
207 aa  234  8e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  51.04 
 
 
202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  49.48 
 
 
207 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  48.4 
 
 
200 aa  201  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  51.08 
 
 
194 aa  201  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  50.27 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  47.57 
 
 
200 aa  191  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  46.03 
 
 
204 aa  190  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  45.41 
 
 
216 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  45.41 
 
 
216 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  43.46 
 
 
203 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  46.56 
 
 
202 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  47.09 
 
 
209 aa  184  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  46.03 
 
 
202 aa  184  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  48.69 
 
 
199 aa  184  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  43.28 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  48.68 
 
 
203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  46.74 
 
 
206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  46.56 
 
 
204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  45.99 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  45.16 
 
 
197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  48.91 
 
 
210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  44.97 
 
 
209 aa  180  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  42.57 
 
 
202 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  44.57 
 
 
209 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  41.41 
 
 
212 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  43.98 
 
 
210 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  42.86 
 
 
204 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  46.74 
 
 
206 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  44.97 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  41.88 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  43.39 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  44.94 
 
 
186 aa  178  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  42.33 
 
 
195 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  45.11 
 
 
206 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  44.21 
 
 
205 aa  177  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  46.11 
 
 
216 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  40.22 
 
 
198 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  45 
 
 
221 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  45 
 
 
221 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  46.24 
 
 
203 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  42.71 
 
 
215 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  45.65 
 
 
214 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  46.2 
 
 
206 aa  175  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  45 
 
 
221 aa  175  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  46.2 
 
 
206 aa  175  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  40.22 
 
 
198 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  40.22 
 
 
198 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  44.97 
 
 
206 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  42.55 
 
 
206 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  45.7 
 
 
203 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  46.86 
 
 
192 aa  174  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  48.24 
 
 
191 aa  174  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  42.86 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  44.44 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  46 
 
 
225 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  47.22 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  42.86 
 
 
223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  42.56 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  42.86 
 
 
223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  45.45 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  44.39 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  41.3 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  43.89 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  41.09 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  44.44 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  42.5 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  42.5 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  42.08 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02367  guanylate kinase  44.51 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  40.76 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  42.86 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  45.5 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  42.65 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  43.38 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  43.85 
 
 
216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  38.71 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  42.11 
 
 
202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1256  guanylate kinase  47.64 
 
 
203 aa  171  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  43.58 
 
 
185 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  43.68 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  44.97 
 
 
207 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  42.55 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  45.65 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  42.86 
 
 
199 aa  171  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  46.11 
 
 
205 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  43.56 
 
 
220 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0545  guanylate kinase  47.15 
 
 
203 aa  169  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  39.89 
 
 
203 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  42.39 
 
 
206 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  45.78 
 
 
223 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  43.85 
 
 
190 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45.81 
 
 
207 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  46.89 
 
 
205 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  46.89 
 
 
206 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  42.46 
 
 
188 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  42.46 
 
 
184 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>