More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0088 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0088  GrpE protein  100 
 
 		 183 aa  352  2e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.141966  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  45.81 
 
 		 172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  45.81 
 
 		 172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1243  GrpE protein  46.45 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.847683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  36.93 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  36.72 
 
 		 221 aa  94.7  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 		 213 aa  94.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1824  GrpE protein  38.1 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.311455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  31.98 
 
 		 208 aa  92  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  31.67 
 
 		 239 aa  91.3  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  33.96 
 
 		 274 aa  90.1  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  32 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  32.2 
 
 		 239 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  32.02 
 
 		 213 aa  89  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  28.96 
 
 		 259 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  28.65 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  34.12 
 
 		 239 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  31.87 
 
 		 208 aa  88.2  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.16 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  28.42 
 
 		 259 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  33.13 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  30.15 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  30.51 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  38.81 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  30.86 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  29.75 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  32.2 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  33.33 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  31.08 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  32.09 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  33.12 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  32.68 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  31.01 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  30.19 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  30.41 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  33.33 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  30.47 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  30.95 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  29.89 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  33.59 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  32.28 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  31.13 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  27.57 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  28.76 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.7 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  34.35 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  30.2 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  27.38 
 
 		 282 aa  74.7  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  28.32 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.98 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  33.07 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  29.71 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  25.89 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  29.69 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  28.02 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  34.01 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  27.22 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  25.97 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  32 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  30.82 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  28.42 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  32.12 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  30.56 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  30 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  33.1 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  28.65 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  25.37 
 
 		 243 aa  70.9  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  27.78 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  26.74 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  32.82 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  25.97 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  34.11 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  30.14 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  26.25 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  29.55 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  29.93 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  30.99 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  28.67 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  28.24 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  26.14 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  30.56 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  28.08 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  27.67 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>