More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0086 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  100 
 
 
279 aa  560  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  55.23 
 
 
294 aa  309  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  53.73 
 
 
281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  53.36 
 
 
281 aa  299  4e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  32.95 
 
 
345 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  31.68 
 
 
342 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  31.46 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  34.29 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  31.02 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  28.27 
 
 
328 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  33.89 
 
 
263 aa  132  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  30.04 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  29.33 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  29.23 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  29.23 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  30.22 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  29.92 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  30.36 
 
 
278 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  32.27 
 
 
258 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  31.58 
 
 
258 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  30.94 
 
 
277 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  30.68 
 
 
258 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  30.82 
 
 
250 aa  122  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  32.37 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  29.25 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.04 
 
 
251 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  31.82 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  31.47 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  30.04 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  29.48 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.77 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  32.52 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  29.75 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  31.45 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  30.5 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  30.17 
 
 
622 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  28.69 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  29 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  31.25 
 
 
328 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  32.35 
 
 
241 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  31.28 
 
 
248 aa  112  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  32.35 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  30.83 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  31.15 
 
 
246 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  28.78 
 
 
264 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  30.74 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  33.62 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  30.74 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  29.25 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  29.63 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  27.88 
 
 
275 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  30.34 
 
 
271 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  30.29 
 
 
283 aa  106  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  29.12 
 
 
246 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  29.77 
 
 
246 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  32.71 
 
 
279 aa  105  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  29.52 
 
 
238 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  29.06 
 
 
273 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  30.2 
 
 
247 aa  104  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  29.71 
 
 
257 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  28.52 
 
 
277 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1437  NAD+ synthetase  31.32 
 
 
249 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  27.43 
 
 
273 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  29.03 
 
 
248 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  29.88 
 
 
267 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  33.61 
 
 
304 aa  99.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2828  NAD+ synthetase  27.94 
 
 
280 aa  99.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  29.1 
 
 
283 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  27.41 
 
 
237 aa  99  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  27.2 
 
 
277 aa  99  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  28.95 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  26.58 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  30.58 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  26 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  28.63 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2324  NAD+ synthetase  29.92 
 
 
326 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297983  hitchhiker  0.00625352 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11710  NAD+ synthetase  26.75 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.996966  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  28.23 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  27.85 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  27.21 
 
 
546 aa  95.5  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  26.16 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19800  NAD+ synthetase  28.16 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.497011  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  29.96 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  29.25 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  27.5 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  25.85 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  29.25 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  27.34 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.41 
 
 
542 aa  90.5  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  28.41 
 
 
542 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  29.67 
 
 
561 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1044  NAD+ synthetase  33.65 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6284  NAD+ synthetase  26.12 
 
 
566 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000396806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  26.52 
 
 
556 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  28.79 
 
 
554 aa  89.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  28.09 
 
 
554 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03120  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.98 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.2 
 
 
543 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  42.86 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  26.32 
 
 
541 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>