135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0085 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 403 aa  805    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  54.13 
 
 		 412 aa  436  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  51.85 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  51.85 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  51.58 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  45.19 
 
 		 410 aa  343  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  41.73 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  41.04 
 
 		 441 aa  272  9e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  37.82 
 
 		 443 aa  249  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  39.14 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  35.25 
 
 		 421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  38.06 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  35.71 
 
 		 459 aa  240  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  38.06 
 
 		 428 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  37.74 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  35.12 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  38.23 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  36.17 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  33.33 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  39.35 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  33.87 
 
 		 452 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  31.79 
 
 		 486 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  34.44 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  36.97 
 
 		 458 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  34.31 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  32.42 
 
 		 422 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  32.25 
 
 		 445 aa  209  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  34.92 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1111  hydroxypyruvate reductase  37.04 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.961432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  31.69 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  36.13 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  30.71 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  32.96 
 
 		 496 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  29.79 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  35.57 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  35.39 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  32.71 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  32.06 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  33.89 
 
 		 439 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  34.17 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  34.17 
 
 		 443 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  31.4 
 
 		 446 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  35.89 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  32.37 
 
 		 424 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  33.89 
 
 		 439 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  32.62 
 
 		 420 aa  200  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  35.36 
 
 		 422 aa  199  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  33.42 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  31.73 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  31.43 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  31.33 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  32.28 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  32.34 
 
 		 448 aa  196  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  32.99 
 
 		 438 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  32.09 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  30.57 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  31.66 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  34.32 
 
 		 450 aa  193  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  32.72 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  30.57 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  33.61 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  32.65 
 
 		 504 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  32.63 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  33.16 
 
 		 428 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  29.44 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  30.95 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  29.44 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  33.33 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  31.3 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  34.73 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  30.85 
 
 		 432 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  34.06 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  32.87 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  32.92 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  32.8 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  33.04 
 
 		 625 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  32.74 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  32.68 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  33.43 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  33.05 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  32.96 
 
 		 421 aa  183  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  32.77 
 
 		 424 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  33.51 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  32.77 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0604  Glycerate kinase  34 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  32.87 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  34.19 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  32.77 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  31.73 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  30.07 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  33.24 
 
 		 440 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  31.36 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  32.68 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3567  hydroxypyruvate reductase  34.16 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  31.57 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  30.59 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  29.91 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  32 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  31.79 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>