299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0080 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  83.09 
 
 		 136 aa  241  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  69.34 
 
 		 137 aa  209  7.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  67.65 
 
 		 137 aa  207  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  68.38 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  65.69 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  61.38 
 
 		 145 aa  191  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  65.69 
 
 		 137 aa  190  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  61.87 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  61.15 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  58.7 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  59.71 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  60.43 
 
 		 157 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  58.27 
 
 		 139 aa  176  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  59.42 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  58.27 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  59.42 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  56.12 
 
 		 139 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  57.55 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  57.55 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  57.97 
 
 		 584 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  57.55 
 
 		 139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  58.7 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  56.83 
 
 		 139 aa  170  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  56.83 
 
 		 139 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  57.25 
 
 		 138 aa  169  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  57.97 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  55.4 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  57.97 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  56.83 
 
 		 139 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  57.86 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  59.42 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  57.55 
 
 		 139 aa  168  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  56.12 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  57.55 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  56.12 
 
 		 138 aa  167  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  55.4 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  56.12 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  56.83 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  54.68 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  56.2 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1520  protein of unknown function UPF0047  54.68 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0913014  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  55.4 
 
 		 139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  56.83 
 
 		 138 aa  163  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  55.07 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  54.68 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  55.4 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  56.52 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  55.4 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  54.68 
 
 		 139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  54.68 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0955  protein of unknown function UPF0047  53.24 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0812583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  53.96 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  53.96 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22360  hypothetical protein  59.38 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  42.34 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  40.88 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  39.42 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  40.94 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  36.03 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  38.28 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  32.82 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  39.06 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  38.24 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  36.64 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  35.88 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.88 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  38.21 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  37.3 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  38.64 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  36.43 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  37.6 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  36.43 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  37.21 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  37.6 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  36.72 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  36.8 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  35.11 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  34.06 
 
 		 139 aa  87  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  38.71 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  32.03 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  34.92 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  33.87 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  36.29 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  36 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  38.84 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  34.81 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  35.2 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  32.86 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  37.01 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  35.66 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  33.58 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  36 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  33.08 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>