108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0078 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0078  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 209 aa  432  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  52.88 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 209 aa  194  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  43.9 
 
 		 207 aa  191  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  25.37 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 266 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  25.35 
 
 		 229 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 296 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  24.09 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  26.95 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  24.57 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  24.57 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  24.57 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  24.57 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  24.57 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  24.57 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  27.27 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.57 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  23.29 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  22.37 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  24.43 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 		 306 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  24.43 
 
 		 308 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  23.03 
 
 		 309 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  23.7 
 
 		 308 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1091  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.801328  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 		 266 aa  45.4  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 		 340 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 329 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0442  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 174 aa  45.4  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000184233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  24.28 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  23.76 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  23.15 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  24.16 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  24.65 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  23.57 
 
 		 318 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  23.2 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  28.18 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  22.06 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  29.11 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1537  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299515  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  25 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  20.45 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  25.47 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  41.07 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 		 302 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  25.15 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 		 330 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 321 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  21.92 
 
 		 307 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  21.48 
 
 		 308 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 		 250 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.71 
 
 		 318 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  23.26 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  22.09 
 
 		 303 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  26.09 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 		 310 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 		 330 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 		 280 aa  42  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 312 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  25.29 
 
 		 216 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 278 aa  42  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1442  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 203 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1316  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 263 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>