More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0065 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  67.09 
 
 		 469 aa  676    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 473 aa  959    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  62.89 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  62.68 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 488 aa  546  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 485 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 482 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 490 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 486 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 478 aa  395  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 491 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 491 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 484 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 485 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 480 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  42.71 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 498 aa  360  4e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 467 aa  360  4e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.09 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 492 aa  356  5e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 495 aa  352  8.999999999999999e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  40.49 
 
 		 518 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 483 aa  351  1e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 492 aa  350  4e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 463 aa  349  5e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 504 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 504 aa  348  2e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 466 aa  345  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 500 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 482 aa  342  5.999999999999999e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 493 aa  342  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 465 aa  342  8e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 484 aa  342  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 504 aa  341  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 468 aa  338  9e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 498 aa  336  5e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1080  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 445 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 502 aa  334  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 484 aa  333  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 484 aa  333  5e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 470 aa  333  6e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 480 aa  333  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 487 aa  332  8e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 467 aa  332  9e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 502 aa  331  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 502 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 481 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  36.2 
 
 		 588 aa  330  3e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 471 aa  329  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>