More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0064 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 469 aa  965    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  68.45 
 
 		 470 aa  680    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 460 aa  597  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 460 aa  597  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1831  cysteinyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 469 aa  532  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 465 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 476 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 485 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 487 aa  431  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 478 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 487 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 485 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 479 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 486 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 477 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 484 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 488 aa  404  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 447 aa  395  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  41.36 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 489 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 490 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 486 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 478 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 460 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 488 aa  388  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>