More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0044 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0044  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
188 aa  383  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1416  riboflavin synthase subunit alpha  50.56 
 
 
197 aa  189  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0994  riboflavin synthase subunit alpha  51.41 
 
 
190 aa  188  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1112  riboflavin synthase subunit alpha  53.37 
 
 
182 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  40.96 
 
 
213 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 
219 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 
210 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  42.27 
 
 
204 aa  136  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  41.05 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  45.12 
 
 
217 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  45.12 
 
 
217 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  40.43 
 
 
209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  41.8 
 
 
213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  40.84 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  38.02 
 
 
239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  41.4 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  39.47 
 
 
219 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  38.12 
 
 
241 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  39.89 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  36.17 
 
 
216 aa  124  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 
217 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  37.7 
 
 
221 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  39.68 
 
 
207 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  41.27 
 
 
217 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 
205 aa  122  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 
221 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  40.43 
 
 
217 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  36.55 
 
 
208 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
217 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.89 
 
 
218 aa  120  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  38.3 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  38.1 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  40.76 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  44.52 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  38.3 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  42.94 
 
 
230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 
229 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 
229 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0773  riboflavin synthase subunit alpha  33.51 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 
198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  36 
 
 
215 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  37.17 
 
 
199 aa  118  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  37.13 
 
 
201 aa  118  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  38.42 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  39.36 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0761  riboflavin synthase subunit alpha  38.3 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  39.36 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  36.84 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0657  riboflavin synthase subunit alpha  38.3 
 
 
207 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  38.62 
 
 
200 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  37.77 
 
 
222 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  40.12 
 
 
202 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 
217 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  41.49 
 
 
206 aa  115  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  37.77 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  37.5 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 
201 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 
204 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  33.86 
 
 
220 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  38.83 
 
 
214 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 
202 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 
220 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  39.57 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  39.24 
 
 
205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  37.22 
 
 
203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  34.55 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  38.58 
 
 
198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  39.15 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  38.79 
 
 
203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  36.32 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  40.79 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  37.57 
 
 
216 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  35.48 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  35.35 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  36.32 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 
210 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1231  riboflavin synthase subunit alpha  35.91 
 
 
203 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000560393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  36.84 
 
 
199 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  35.1 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  38.02 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  39.87 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  39.51 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 
205 aa  111  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  36.56 
 
 
214 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 
205 aa  111  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  35.75 
 
 
204 aa  111  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 
220 aa  111  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  40.79 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>