More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0019 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  100 
 
 
319 aa  627  1e-178  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  77.29 
 
 
319 aa  504  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  70.03 
 
 
319 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  70.03 
 
 
319 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  61.83 
 
 
316 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  47.73 
 
 
305 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  44.52 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  45.1 
 
 
306 aa  265  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  51.01 
 
 
309 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  46.62 
 
 
307 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  48.05 
 
 
319 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  47.73 
 
 
319 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  48.05 
 
 
319 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  48.05 
 
 
319 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  48.05 
 
 
319 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  48.05 
 
 
319 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  47.73 
 
 
319 aa  248  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  50.68 
 
 
308 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  47.39 
 
 
319 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  47.83 
 
 
344 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  44.08 
 
 
321 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  42.9 
 
 
321 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  39.61 
 
 
323 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  40.26 
 
 
323 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  42.49 
 
 
321 aa  228  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  43.84 
 
 
312 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  41.56 
 
 
323 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  42.17 
 
 
303 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  41.35 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  40.58 
 
 
323 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  43.93 
 
 
318 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
321 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  40.58 
 
 
321 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  42.77 
 
 
318 aa  221  9e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  41.06 
 
 
311 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  44.56 
 
 
300 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  41.56 
 
 
323 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
447 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  40.58 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  41.56 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  41.45 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  39.93 
 
 
425 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  40.06 
 
 
325 aa  212  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
440 aa  212  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  42.14 
 
 
318 aa  211  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  40.6 
 
 
284 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  40.6 
 
 
284 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  41.36 
 
 
317 aa  209  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  39.94 
 
 
322 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  41.02 
 
 
435 aa  208  9e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  40.62 
 
 
319 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  40.91 
 
 
318 aa  206  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  42.67 
 
 
319 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  40.46 
 
 
346 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  38.77 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  40.75 
 
 
288 aa  199  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  41.75 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  41.47 
 
 
435 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  37.79 
 
 
310 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  38.38 
 
 
314 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  40.58 
 
 
310 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  42.14 
 
 
426 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
288 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  37.99 
 
 
425 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  37.13 
 
 
293 aa  189  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  38.85 
 
 
429 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
426 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  39.6 
 
 
430 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
317 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
445 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  36.82 
 
 
301 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  37.94 
 
 
317 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  40.85 
 
 
444 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  38.83 
 
 
293 aa  182  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  37.62 
 
 
304 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 
317 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  38.93 
 
 
311 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  34.32 
 
 
309 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  40.14 
 
 
430 aa  175  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  40.2 
 
 
428 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  37.95 
 
 
305 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  35.81 
 
 
315 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
313 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0458  inner-membrane translocator  36.63 
 
 
293 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  35.6 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
310 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  36.65 
 
 
317 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  37 
 
 
312 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  35.47 
 
 
321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  35.82 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  35.19 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  41.37 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  40 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  38.38 
 
 
429 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 
292 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3178  inner-membrane translocator  36.51 
 
 
351 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.686294  normal  0.1496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>