More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0001 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 437 aa  884    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000928481  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.61 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000143167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0001  chromosomal replication initiation protein  47.33 
 
 		 440 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0001  chromosomal replication initiation protein  46.65 
 
 		 440 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.37 
 
 		 454 aa  349  5e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000297027  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  37.26 
 
 		 453 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  35.21 
 
 		 460 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.75 
 
 		 444 aa  272  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  34.16 
 
 		 482 aa  269  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  33.04 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.11 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.15 
 
 		 463 aa  265  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.81 
 
 		 458 aa  263  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  32.72 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  34.04 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  34.12 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.04 
 
 		 446 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  33.96 
 
 		 456 aa  255  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  34.79 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  35.64 
 
 		 442 aa  253  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  31.8 
 
 		 462 aa  252  9.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.11 
 
 		 447 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  35.01 
 
 		 443 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.24 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.83 
 
 		 452 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.88 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.32 
 
 		 443 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  39.88 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  39.88 
 
 		 457 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  33.56 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  34.94 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.97 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.49 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  32.08 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  38.01 
 
 		 450 aa  241  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.49 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  33.65 
 
 		 436 aa  239  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  32.87 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  32.94 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 		 449 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  35.08 
 
 		 443 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  32.41 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.48 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  31.8 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.46 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.13 
 
 		 439 aa  233  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  32.85 
 
 		 451 aa  232  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  32.04 
 
 		 466 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  30.5 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  31.89 
 
 		 445 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  31.79 
 
 		 492 aa  229  8e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.1 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  31.02 
 
 		 470 aa  229  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.9 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  31.9 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  33.1 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.25 
 
 		 509 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.66 
 
 		 503 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  36.19 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  33.85 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  31.76 
 
 		 450 aa  223  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  34.22 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  29.14 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.85 
 
 		 491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.3 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  29.46 
 
 		 480 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  30.52 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  34.43 
 
 		 436 aa  219  6e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  37.89 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.77 
 
 		 480 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  33.73 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  32.33 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  36.47 
 
 		 500 aa  217  4e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  34.38 
 
 		 492 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.58 
 
 		 498 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  31.21 
 
 		 455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.92 
 
 		 480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  30.09 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.32 
 
 		 469 aa  216  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.38 
 
 		 452 aa  216  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000132407  decreased coverage  0.000453889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3309  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.38 
 
 		 452 aa  216  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  32.71 
 
 		 450 aa  216  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  34.44 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  34.44 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.02 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.81 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.25 
 
 		 528 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>