More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3250 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
253 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  66.8 
 
 
243 aa  316  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  54.51 
 
 
267 aa  251  9e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.38 
 
 
249 aa  213  2e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2386  HesA/MoeB/ThiF family protein  52.12 
 
 
248 aa  212  4e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2016  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.12 
 
 
248 aa  212  4e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.38 
 
 
246 aa  208  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0322  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.03 
 
 
240 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  46.61 
 
 
252 aa  204  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7357e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.15 
 
 
242 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.83 
 
 
258 aa  202  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.69 
 
 
246 aa  201  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.74 
 
 
244 aa  200  2e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  7.38809e-07 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.52 
 
 
258 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57166e-10 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.38 
 
 
258 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.9 
 
 
256 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.84 
 
 
242 aa  189  3e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.19 
 
 
244 aa  188  6e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.18 
 
 
255 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.73518e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.11 
 
 
255 aa  183  2e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.44 
 
 
257 aa  182  5e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1693  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.68 
 
 
255 aa  182  5e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  41.46 
 
 
255 aa  179  5e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.08 
 
 
254 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  8.13417e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.5 
 
 
254 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4181  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.92 
 
 
259 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0515522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.17 
 
 
237 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.3 
 
 
242 aa  171  8e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.25 
 
 
253 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.72262e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  43.83 
 
 
236 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.37 
 
 
253 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.37 
 
 
253 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.59 
 
 
244 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  48.17 
 
 
276 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.2 
 
 
254 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.07 
 
 
268 aa  162  4e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.35 
 
 
246 aa  162  4e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78365e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.75 
 
 
254 aa  162  4e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  2.51146e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  46.2 
 
 
268 aa  161  8e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  46.2 
 
 
268 aa  161  8e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  46.2 
 
 
268 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  46.2 
 
 
268 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  46.2 
 
 
268 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  46.78 
 
 
268 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  46.2 
 
 
266 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.84 
 
 
254 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.55 
 
 
264 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  46.2 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  46.2 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  46.2 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.2 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.2 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.88 
 
 
261 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  46.2 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  36.33 
 
 
275 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.95 
 
 
269 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1681  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.46 
 
 
296 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.33 
 
 
275 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
270 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  37.25 
 
 
269 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  35.92 
 
 
275 aa  155  5e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
272 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.46 
 
 
259 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35994e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.05 
 
 
268 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.33838e-05  hitchhiker  5.27658e-07 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1333  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.69 
 
 
276 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49350  hypothetical protein  47.12 
 
 
270 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0144415  normal  0.0686942 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  45.61 
 
 
266 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.21 
 
 
264 aa  152  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.1 
 
 
244 aa  152  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  41.81 
 
 
272 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.19 
 
 
273 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  38.79 
 
 
255 aa  152  6e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  39.09 
 
 
258 aa  152  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  3.94678e-05  normal  0.987322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.61 
 
 
277 aa  151  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1090  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.69 
 
 
270 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.86 
 
 
263 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4216  hypothetical protein  46.07 
 
 
270 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.57 
 
 
252 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.123515  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.95 
 
 
277 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.2 
 
 
275 aa  147  1e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  39.57 
 
 
255 aa  147  1e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.45261e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  39.57 
 
 
255 aa  147  1e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.82259e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  39.57 
 
 
255 aa  147  2e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.45557e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.97 
 
 
255 aa  147  2e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  39.57 
 
 
255 aa  147  2e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.36944e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  39.57 
 
 
255 aa  147  2e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.13687e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  39.57 
 
 
255 aa  147  2e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  39.57 
 
 
255 aa  147  2e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.45686e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  39.57 
 
 
255 aa  147  2e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  6.92664e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.6 
 
 
269 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.68 
 
 
255 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.96284e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  38.72 
 
 
255 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  9.90791e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39130  ThiF-/MoeB-like protein  45.03 
 
 
270 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.107651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.72 
 
 
255 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2895  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.65 
 
 
274 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1191  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.55 
 
 
258 aa  142  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.237248  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06440  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  42.33 
 
 
247 aa  142  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.217123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3258  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.6 
 
 
268 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.15 
 
 
240 aa  142  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1686  hypothetical protein  37.96 
 
 
257 aa  140  1e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  3.36589e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>