292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3239 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 613 aa  1225    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  63.87 
 
 		 627 aa  749    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  61.61 
 
 		 650 aa  719    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  68.58 
 
 		 612 aa  838    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  55.9 
 
 		 620 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  47.09 
 
 		 608 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  40.13 
 
 		 615 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1981  TrkA domain-containing protein  39.87 
 
 		 620 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0994833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2059  sulfur deprivation response regulator  39.87 
 
 		 620 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01839  sulfur deprivation response regulator  39.01 
 
 		 620 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  39.68 
 
 		 595 aa  378  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.73 
 
 		 613 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  30.71 
 
 		 588 aa  286  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  31.45 
 
 		 609 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.95 
 
 		 611 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.67 
 
 		 602 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.67 
 
 		 596 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.29 
 
 		 612 aa  260  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.24 
 
 		 609 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.76 
 
 		 609 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.7 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.08 
 
 		 593 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.71 
 
 		 596 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.1 
 
 		 597 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.39 
 
 		 596 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  30.56 
 
 		 611 aa  248  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.78 
 
 		 623 aa  247  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  30.69 
 
 		 610 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.44 
 
 		 610 aa  246  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.85 
 
 		 610 aa  246  9e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  31.03 
 
 		 609 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  30.9 
 
 		 610 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.88 
 
 		 609 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.7 
 
 		 610 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.7 
 
 		 610 aa  243  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  30.3 
 
 		 608 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.7 
 
 		 610 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  30.3 
 
 		 608 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.7 
 
 		 610 aa  243  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.7 
 
 		 610 aa  243  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.97 
 
 		 627 aa  243  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  29.86 
 
 		 610 aa  242  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  30.5 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  30.14 
 
 		 608 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  30.14 
 
 		 608 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  30.14 
 
 		 608 aa  240  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.9 
 
 		 610 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  30.54 
 
 		 610 aa  239  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.38 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.9 
 
 		 630 aa  239  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 592 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  29.32 
 
 		 608 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  29.87 
 
 		 605 aa  238  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.9 
 
 		 610 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  28.93 
 
 		 588 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  29.78 
 
 		 619 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  29.88 
 
 		 621 aa  237  6e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  30.51 
 
 		 609 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.3 
 
 		 609 aa  236  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.72 
 
 		 616 aa  233  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.33 
 
 		 622 aa  233  8.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 		 605 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  28.25 
 
 		 604 aa  232  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  29.14 
 
 		 606 aa  230  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  25.98 
 
 		 619 aa  229  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  29.82 
 
 		 589 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  31.38 
 
 		 613 aa  221  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  28.25 
 
 		 620 aa  219  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  29.27 
 
 		 627 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  28.24 
 
 		 609 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  25.9 
 
 		 594 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  29.54 
 
 		 581 aa  214  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  28.08 
 
 		 588 aa  214  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  28.85 
 
 		 593 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  26.98 
 
 		 608 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30.18 
 
 		 618 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  28.06 
 
 		 586 aa  212  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.9 
 
 		 616 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 		 591 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  29.63 
 
 		 591 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  27.52 
 
 		 605 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  28.32 
 
 		 605 aa  203  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  27.57 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  28.07 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 		 588 aa  200  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  28.43 
 
 		 601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  25.81 
 
 		 590 aa  199  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  29.33 
 
 		 593 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  25.3 
 
 		 590 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  26.56 
 
 		 591 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  28.62 
 
 		 598 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  26.35 
 
 		 607 aa  193  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  26.89 
 
 		 591 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  26.92 
 
 		 596 aa  190  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  27.8 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  27.87 
 
 		 604 aa  188  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  26.9 
 
 		 589 aa  188  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  27.92 
 
 		 632 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 		 588 aa  187  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  26.53 
 
 		 600 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>