25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3168 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  55.56 
 
 		 291 aa  314  9e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  40.75 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  40.29 
 
 		 311 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  35.79 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  35.81 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  38.73 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  36.17 
 
 		 334 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  36.4 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  38.43 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  35.2 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  34.59 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  32.6 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  30.95 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  32.75 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  30.3 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  29.96 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  31.63 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  30.67 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  42.27 
 
 		 102 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  42.27 
 
 		 102 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  26.88 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  26.27 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  24.03 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>